More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_41870 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_40530  Transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
236 aa  477  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41870  Transposase IS116/IS110/IS902  100 
 
 
236 aa  477  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09760  Transposase, IS111A/IS1328/IS1533  99.58 
 
 
346 aa  478  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  64.63 
 
 
341 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0505  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.63 
 
 
341 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.63 
 
 
341 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.63 
 
 
341 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.63 
 
 
341 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.63 
 
 
341 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220936  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0125  IS5075 transposase  60.26 
 
 
334 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0140  transposase InsD1 for insertion sequence IS4321R  60.26 
 
 
334 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0169  transposase InsD2 for insertion sequence IS4321L  59.83 
 
 
334 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0372  ISPsy7, transposase  48.91 
 
 
340 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2167  ISPsy7, transposase  48.91 
 
 
340 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2465  ISPsy7, transposase  48.91 
 
 
340 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3146  ISPsy7, transposase  48.91 
 
 
340 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0791519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3274  ISPsy7, transposase  48.91 
 
 
340 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0336107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3325  ISPsy7, transposase  48.91 
 
 
340 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0495526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3746  ISPsy7, transposase  48.91 
 
 
340 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26483  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3800  ISPsy7, transposase  48.91 
 
 
340 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5571  ISPsy7, transposase  48.91 
 
 
340 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2485  ISPsy7, transposase  48.47 
 
 
340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00294179  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  47.83 
 
 
340 aa  217  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.21 
 
 
499 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07105  hypothetical protein  41.56 
 
 
391 aa  186  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.84 
 
 
346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.91 
 
 
347 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.43 
 
 
338 aa  178  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.43 
 
 
338 aa  178  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.43 
 
 
338 aa  178  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.43 
 
 
338 aa  178  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.43 
 
 
338 aa  178  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.43 
 
 
338 aa  178  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.43 
 
 
338 aa  178  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.43 
 
 
338 aa  178  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2266  transposase IS116/IS110/IS902  41.7 
 
 
284 aa  177  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.17 
 
 
344 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0345  transposase IS116/IS110/IS902  42.26 
 
 
343 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222608  normal  0.211948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1921  transposase IS116/IS110/IS902  42.26 
 
 
343 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.876079  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3076  transposase IS116/IS110/IS902  42.26 
 
 
343 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.5 
 
 
343 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2447  transposase IS116/IS110/IS902  42.02 
 
 
343 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3074  transposase IS116/IS110/IS902  42.02 
 
 
343 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.5 
 
 
343 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1939  transposase IS116/IS110/IS902  42.67 
 
 
374 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143032  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.7 
 
 
338 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.7 
 
 
338 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.7 
 
 
338 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  38.7 
 
 
338 aa  170  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  38.7 
 
 
338 aa  170  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  38.7 
 
 
338 aa  170  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  38.7 
 
 
338 aa  170  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.7 
 
 
338 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3848  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.7 
 
 
234 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.00000966346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.26 
 
 
338 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0852  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.7 
 
 
234 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.7 
 
 
338 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3155  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.02 
 
 
346 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3116  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.02 
 
 
346 aa  166  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.914842  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0524  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.26 
 
 
302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  37.83 
 
 
338 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02812  hypothetical protein  39.04 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01475  hypothetical protein  39.04 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05053  hypothetical protein  39.04 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.31 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.31 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08193  transposase  39.04 
 
 
338 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1569  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.91 
 
 
342 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196029 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1895  ISAfe1, transposase  38.91 
 
 
342 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3183  ISAfe1, transposase  38.91 
 
 
342 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487441  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4139  transposase IS116/IS110/IS902  39.91 
 
 
349 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2781  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.91 
 
 
342 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.91 
 
 
342 aa  160  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0834  transposase IS116/IS110/IS902  40.59 
 
 
343 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220678  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3882  transposase, IS1111 family  39.47 
 
 
339 aa  159  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2240  transposase, IS1111 family  39.47 
 
 
339 aa  159  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000963569  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.88 
 
 
345 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02906  probable transposase  39.39 
 
 
347 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.142425  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6180  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.17 
 
 
336 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626192  hitchhiker  0.00140825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  37.24 
 
 
343 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0943  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.69 
 
 
338 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.69 
 
 
338 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  39.32 
 
 
338 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  39.32 
 
 
338 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  39.32 
 
 
338 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  39.32 
 
 
338 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  39.32 
 
 
338 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  39.32 
 
 
338 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  35.62 
 
 
341 aa  151  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  35.62 
 
 
341 aa  151  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0268  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.7 
 
 
350 aa  151  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0803488 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2657  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.7 
 
 
350 aa  151  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2913  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.39 
 
 
339 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  40.09 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  40.09 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  40.09 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.25 
 
 
350 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.25 
 
 
350 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.25 
 
 
350 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  36.25 
 
 
350 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>