194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8072 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8072  transposase  100 
 
 		 94 aa  193  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  98.94 
 
 		 238 aa  192  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  95.74 
 
 		 238 aa  186  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  95.74 
 
 		 238 aa  186  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  87.23 
 
 		 238 aa  173  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  86.17 
 
 		 238 aa  171  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7541  transposase  82.98 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  80.85 
 
 		 238 aa  162  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  79.79 
 
 		 243 aa  162  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  79.78 
 
 		 180 aa  155  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  61.8 
 
 		 237 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  63.53 
 
 		 232 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  61.18 
 
 		 237 aa  114  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  55.17 
 
 		 236 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  57.32 
 
 		 236 aa  96.3  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  57.32 
 
 		 236 aa  96.3  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  57.32 
 
 		 236 aa  96.3  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  52.94 
 
 		 233 aa  94.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  50 
 
 		 237 aa  94.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  50 
 
 		 237 aa  94.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  50 
 
 		 237 aa  94.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  50 
 
 		 237 aa  94.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  50 
 
 		 237 aa  94.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  50 
 
 		 237 aa  94.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  50 
 
 		 237 aa  94.4  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  49.43 
 
 		 233 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  51.72 
 
 		 233 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  51.72 
 
 		 233 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  51.72 
 
 		 233 aa  92.8  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  51.72 
 
 		 233 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  44.94 
 
 		 238 aa  83.6  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  44.94 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  44.94 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  44.94 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  46.34 
 
 		 251 aa  80.1  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  45.24 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  44.57 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  45.24 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  45.24 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  45.24 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  45.24 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  45.24 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  40.7 
 
 		 233 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  43.48 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  40.48 
 
 		 233 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  40.48 
 
 		 233 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  40.48 
 
 		 233 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  40.48 
 
 		 233 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  40.48 
 
 		 233 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4777  putative transposase  65.96 
 
 		 52 aa  70.1  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5571  putative transposase  42.86 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  40.7 
 
 		 233 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7514  transposase  52.38 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1456  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  41.77 
 
 		 262 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2646  hypothetical protein  43.86 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0437293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  40.51 
 
 		 236 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3882  transposase, putative  36.14 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.227634 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7470  transposase  70.97 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0568  transposase  32.05 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.084687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  39.24 
 
 		 236 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  38.1 
 
 		 238 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  40.51 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  39.24 
 
 		 236 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  40.51 
 
 		 237 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  40.51 
 
 		 224 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  39.24 
 
 		 237 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  34.57 
 
 		 226 aa  52  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  34.57 
 
 		 226 aa  52  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  34.57 
 
 		 226 aa  52  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  29.89 
 
 		 235 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  39.19 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0252  transposase  47.92 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000199442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0152  transposase  34.57 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  35.63 
 
 		 238 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  39.19 
 
 		 213 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  32.05 
 
 		 228 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  39.39 
 
 		 212 aa  50.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  36.36 
 
 		 226 aa  49.7  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  36.9 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  26.97 
 
 		 235 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0249  IS431mec-like transposase  34.94 
 
 		 224 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  36.49 
 
 		 213 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  26.44 
 
 		 235 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2299  hypothetical protein  37.7 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  30.12 
 
 		 264 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  30.12 
 
 		 254 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  30.12 
 
 		 254 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  32.1 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  32.1 
 
 		 226 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  27.38 
 
 		 302 aa  47.8  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  38.1 
 
 		 263 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  26.44 
 
 		 235 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  27.38 
 
 		 235 aa  47  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3761  hypothetical protein  39.29 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  32.1 
 
 		 226 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  32.1 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  32.1 
 
 		 226 aa  47  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  30.77 
 
 		 228 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>