19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8050 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  86.95 
 
 		 3372 bp  1927    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  83.62 
 
 		 3303 bp  1398    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8050    100 
 
 		 3294 bp  6530    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.481036  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7064  Dtr system oriT relaxase  88.58 
 
 		 3303 bp  1766    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590726  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4540  Dtr system oriT relaxase  82.35 
 
 		 3324 bp  139  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  85.06 
 
 		 3324 bp  123  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  82.93 
 
 		 3309 bp  103  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  83.22 
 
 		 3309 bp  97.6  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4334  MobA/MobL protein  83.02 
 
 		 4674 bp  67.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  90.74 
 
 		 3288 bp  67.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0326  conjugal transfer relaxase TraA  89.29 
 
 		 2859 bp  63.9  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9595  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  87.1 
 
 		 4071 bp  60  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.973742  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  88.89 
 
 		 3309 bp  60  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1152  conjugal transfer relaxase TraA  92.68 
 
 		 2859 bp  58  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00271398  unclonable  0.000000434964 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  92.5 
 
 		 3297 bp  56  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  87.27 
 
 		 2997 bp  54  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  94.29 
 
 		 3318 bp  54  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  88 
 
 		 4611 bp  52  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  96.67 
 
 		 3297 bp  52  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>