More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7406 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7406  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase reductase component  100 
 
 
211 aa  441  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.46542  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.88 
 
 
175 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2341  flavin reductase-like, FMN-binding  42.68 
 
 
165 aa  116  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236422  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.1 
 
 
201 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  36.94 
 
 
169 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.53 
 
 
172 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  38.31 
 
 
202 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  36.53 
 
 
172 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  35.29 
 
 
164 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  33.33 
 
 
170 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2464  flavin reductase-like, FMN-binding  35.22 
 
 
170 aa  97.1  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00765  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  35.06 
 
 
176 aa  97.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.62 
 
 
164 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.94 
 
 
181 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.18 
 
 
180 aa  94.7  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  33.97 
 
 
164 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  33.97 
 
 
164 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  33.97 
 
 
164 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  33.97 
 
 
164 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  33.97 
 
 
164 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10990  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  32.68 
 
 
170 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.699106  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  33.97 
 
 
164 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2356  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  32.47 
 
 
165 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4430  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.02 
 
 
170 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.29 
 
 
181 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2452  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  32.47 
 
 
165 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1639  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  32.47 
 
 
165 aa  94.4  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0635  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  30.13 
 
 
171 aa  93.2  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543019  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1079  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.88 
 
 
202 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155431  normal  0.0275132 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  33.33 
 
 
164 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.66 
 
 
184 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  34.64 
 
 
178 aa  92  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  36.6 
 
 
164 aa  92  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1819  flavin reductase domain-containing protein  33.97 
 
 
175 aa  92  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.988242  hitchhiker  0.00551903 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  34.64 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  32.9 
 
 
167 aa  89.4  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  33.97 
 
 
176 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  36.91 
 
 
173 aa  88.6  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5089  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  33.14 
 
 
184 aa  88.2  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  35.62 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  36.91 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2167  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  31.29 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  33.12 
 
 
169 aa  87  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  33.76 
 
 
171 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2213  flavin reductase domain-containing protein  32.47 
 
 
165 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1180  flavin reductase-like, FMN-binding  31.85 
 
 
165 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669714  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1162  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  30.13 
 
 
170 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.444908  normal  0.733145 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  33.12 
 
 
170 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0712  flavin reductase-like, FMN-binding  34.84 
 
 
169 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195047  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1057  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  30.13 
 
 
170 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1193  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  30.13 
 
 
170 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1208  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  30.13 
 
 
170 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  32.28 
 
 
171 aa  85.1  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6112  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  30.77 
 
 
186 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980333  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1173  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  30.13 
 
 
170 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2506  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  32.68 
 
 
216 aa  84.7  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64515  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5345  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  33.91 
 
 
181 aa  84.7  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0297424  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  31.61 
 
 
180 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1225  flavin:NADH reductase  32 
 
 
147 aa  84.3  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00730125  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5217  flavoprotein oxidoreductase  38.19 
 
 
149 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  33.12 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  33.56 
 
 
154 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3806  flavin reductase domain-containing protein  34.84 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6513  flavin reductase domain-containing protein  33.12 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.226456  normal  0.292834 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04221  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  27.56 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04187  hypothetical protein  27.56 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3711  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  27.56 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.390593  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4881  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  27.56 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4575  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  27.56 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.39 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3609  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  32.68 
 
 
181 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537664  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3515  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  33.33 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.440753  normal  0.0189937 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2309  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase coupling protein  30.77 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320999  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  32.93 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  31.41 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  31.41 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.36 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1584  flavin reductase-like, FMN-binding  32.14 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0316  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  31.82 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00660064  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  32.08 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3911  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  31.37 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1316  flavin reductase domain-containing protein  31.37 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2295  flavin reductase domain-containing protein  31.37 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1029  flavin reductase domain-containing protein  31.37 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736467  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2123  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.36 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527978 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2006  flavin reductase domain-containing protein  31.37 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  31.85 
 
 
167 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  32.47 
 
 
162 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0096  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5076  flavin reductase domain-containing protein  29.3 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848453  normal  0.150836 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3186  flavin reductase domain-containing protein  30.92 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.528706  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3059  flavin reductase domain-containing protein  31.08 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  30.63 
 
 
172 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2298  flavin reductase domain-containing protein  30.41 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  33.54 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.68 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1403  flavin reductase domain-containing protein  31.08 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.25 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>