49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3741 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3022  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  231  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.536678  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3741  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  231  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1391  hypothetical protein  72.64 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4302  hypothetical protein  58.46 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.26026  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  41.12 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0588  hypothetical protein  42.06 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  36.63 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0722  hypothetical protein  50.79 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  43.01 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2965  hypothetical protein  41.94 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  43.01 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  43.01 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  43.01 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0836  hypothetical protein  42.86 
 
 
197 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0056158  normal  0.0202769 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  43.01 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  43.01 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0946  hypothetical protein  38.95 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  43.01 
 
 
124 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  37.29 
 
 
106 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0507  hypothetical protein  31.11 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648727  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0986  hypothetical protein  31.11 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4090  hypothetical protein  39.33 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0472  hypothetical protein  29.52 
 
 
203 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214849  normal  0.20357 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2151  signal peptide protein  42.22 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000784091  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1035  putative lipoprotein  37.86 
 
 
110 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0858  hypothetical protein  39.77 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0846  hypothetical protein  35.64 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663732  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4375  hypothetical protein  33.75 
 
 
72 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5862  hypothetical protein  44.09 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  51.11 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6038  hypothetical protein  31.53 
 
 
275 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1521  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  50.98 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.705297  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5822  hypothetical protein  40.74 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207187  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  45.28 
 
 
522 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4481  hypothetical protein  51.06 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3888  hypothetical protein  51.06 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3552  hypothetical protein  31.11 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0993493  hitchhiker  0.00882594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  29.31 
 
 
469 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  28.95 
 
 
349 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2413  hypothetical protein  39.44 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2170  hypothetical protein  40 
 
 
479 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.663586  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1201  lipoprotein, putative  32.69 
 
 
110 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3882  hypothetical protein  42.86 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107973  normal  0.566959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1378  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363862  normal  0.0733211 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0534  hypothetical protein  35.45 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292874 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3422  hypothetical protein  50 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2218  signal peptide protein  36.11 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0178  hypothetical protein  38.57 
 
 
421 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000132954  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3171  17 kDa surface antigen  33.33 
 
 
180 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.834604  normal  0.616267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>