More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1874 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1874  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
221 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1149  class II aldolase/adducin family protein  32.66 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0381  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  38.37 
 
 
238 aa  88.6  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2784  class II aldolase/adducin family protein  41.84 
 
 
213 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0402  class II aldolase/adducin family protein  36.32 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  26.89 
 
 
214 aa  85.5  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  36.69 
 
 
217 aa  85.1  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6218  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.09 
 
 
215 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.948817 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.52 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2613  class II aldolase/adducin-like  32.24 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0872  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  36.02 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  35.09 
 
 
219 aa  82  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000402268  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3384  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  34.68 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1734  class II aldolase/adducin family protein  30.41 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0005508  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3525  class II aldolase/adducin family protein  31.78 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3994  class II aldolase/adducin family protein  31.78 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.965081  normal  0.0909381 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.02 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  35.92 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4714  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  36.63 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3273  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.75 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0199942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3663  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.37 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0380  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.91 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  30 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2268  class II aldolase/adducin family protein  38.89 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.043365 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  32.26 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  35.05 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1019  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  33.72 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  30.86 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2887  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11974  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0223  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.59 
 
 
226 aa  74.7  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  30.69 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1862  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  35.47 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0497  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  33.92 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.591725 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06950  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  34.64 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  34.92 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1386  class II aldolase/adducin-like  29.74 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.585457  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  35.36 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0243  class II aldolase/adducin family protein  34.88 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365034  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  31.29 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  34.93 
 
 
222 aa  72  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2754  class II aldolase/adducin family protein  34.64 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0172174  decreased coverage  0.00000252698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  33.93 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  32.97 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0629  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.74 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  31.09 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1566  class II aldolase/adducin-like protein  29.89 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.204198  hitchhiker  0.000158027 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  30.81 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0750  class II aldolase/adducin family protein  37.06 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183817  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1656  aminotransferase  30.72 
 
 
753 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3232  L-fuculose-1-phosphate aldolase  28.95 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  33.14 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0654  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.23 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2248  class II aldolase/adducin family protein  29.26 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.589142  normal  0.160982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5314  L-fuculose-phosphate aldolase  30.06 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.521984  normal  0.999315 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  28.57 
 
 
264 aa  67  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  31.05 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10741  L-fuculose-phosphate aldolase  30.23 
 
 
218 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.4342 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2778  L-fuculose-phosphate aldolase  32.32 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5239  L-fuculose-phosphate aldolase  30.06 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.554285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  30.73 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4772  L-fuculose-phosphate aldolase  30.06 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  27.22 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  30.56 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  28.65 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  28.81 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  30.94 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  27.5 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  31.11 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0324  class II aldolase/adducin family protein  32.24 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  27.46 
 
 
181 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  33.16 
 
 
218 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  28.33 
 
 
190 aa  62.4  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  27.93 
 
 
180 aa  62  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0359  class II aldolase/adducin-like  26.74 
 
 
221 aa  62  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  33.57 
 
 
215 aa  61.6  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0856  L-fuculose phosphate aldolase, putative  28.74 
 
 
395 aa  60.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.668343  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3336  class II aldolase/adducin, N-terminal  29.41 
 
 
209 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348459 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  31.94 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1025  L-fuculose-phosphate aldolase  27.84 
 
 
218 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.916457  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  26.78 
 
 
222 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  33.56 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  31.28 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4213  class II aldolase/adducin family protein  30.48 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  32.12 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  30.56 
 
 
427 aa  59.7  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4596  Fis family transcriptional regulator  26.74 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2573  L-fuculose-phosphate aldolase  29.41 
 
 
222 aa  59.7  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4188  class II aldolase/adducin family protein  30.65 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  28.25 
 
 
231 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  30.41 
 
 
210 aa  59.7  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  28.25 
 
 
243 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2364  L-fuculose phosphate aldolase (class II)  27.32 
 
 
218 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  30.91 
 
 
212 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  30.91 
 
 
212 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  30.91 
 
 
212 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  30.91 
 
 
212 aa  58.9  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  30.91 
 
 
212 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  30.91 
 
 
212 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  30.91 
 
 
212 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>