108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3994 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3525  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
226 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3994  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
226 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.965081  normal  0.0909381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2613  class II aldolase/adducin-like  94.69 
 
 
226 aa  434  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3340  class II aldolase/adducin family protein  47.25 
 
 
243 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1566  class II aldolase/adducin-like protein  45.54 
 
 
242 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.204198  hitchhiker  0.000158027 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1545  hypothetical protein  35.09 
 
 
229 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1874  class II aldolase/adducin family protein  31.78 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0325  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.54 
 
 
232 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1734  class II aldolase/adducin family protein  25.71 
 
 
229 aa  59.3  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0005508  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1810  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.1 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00111407  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2898  class II aldolase/adducin family protein  29.94 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.38221  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1319  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  22.94 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0243  class II aldolase/adducin family protein  28.43 
 
 
226 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365034  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.81 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0381  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.12 
 
 
238 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1019  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.67 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0380  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.96 
 
 
231 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0497  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.66 
 
 
242 aa  52.4  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.591725 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  30.37 
 
 
222 aa  52  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0127  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3787  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  28.07 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0131  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3955  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.39 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  normal  0.918987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3891  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.39 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3273  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.88 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0199942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4714  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.06 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1149  class II aldolase/adducin family protein  29.2 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.942033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4000  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.39 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.850049 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4062  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.39 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.612579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3995  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  23.08 
 
 
233 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0420304  normal  0.534245 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03435  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.34 
 
 
231 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4080  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.34 
 
 
231 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03386  hypothetical protein  24.34 
 
 
231 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  26.53 
 
 
398 aa  48.5  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0105  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.84 
 
 
231 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1656  aminotransferase  27.92 
 
 
753 aa  48.5  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12102  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  26.28 
 
 
217 aa  48.5  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2736  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.24 
 
 
228 aa  48.5  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6218  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.12 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.948817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3663  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3906  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25 
 
 
231 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.936688 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0330  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.73 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0872  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  28.92 
 
 
223 aa  47  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  27.94 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0107  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.18 
 
 
231 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3875  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0112  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.18 
 
 
231 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0648  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  23.79 
 
 
232 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  30.59 
 
 
239 aa  46.2  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2887  class II aldolase/adducin family protein  28.22 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11974  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0108  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  22.22 
 
 
254 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.229114 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0773  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.69 
 
 
230 aa  45.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000354298  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3895  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  23.24 
 
 
233 aa  45.4  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3928  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.46 
 
 
240 aa  45.4  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000124129  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4806  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.17 
 
 
228 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1302  class II aldolase/adducin family protein  25.87 
 
 
427 aa  45.1  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2139  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.55 
 
 
235 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132093  normal  0.896628 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3698  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  23.24 
 
 
233 aa  45.1  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06950  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  37.5 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0112  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  23.53 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.375848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  21.77 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0780  L-fuculose phosphate aldolase  31.11 
 
 
220 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.509551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0608  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  23.68 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.234202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3262  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.85 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2754  class II aldolase/adducin family protein  29.08 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0172174  decreased coverage  0.00000252698 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3939  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.24 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.850936 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0923  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.85 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.809116 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2239  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.06 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.391403  normal  0.0542739 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2021  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.06 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.919407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3395  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.85 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.277672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0053  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  22.22 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2109  class II aldolase/adducin family protein  24.1 
 
 
212 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3467  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.443237  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2396  class II aldolase/adducin family protein  31.82 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0223  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.15 
 
 
226 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0481  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  33.33 
 
 
242 aa  43.1  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4442  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.83 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3815  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  23.81 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0563678 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4656  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.41 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5714  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.83 
 
 
228 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.792036  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1706  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.14 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0268969  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04065  L-ribulose 5-phosphate 4-epimerase  23.81 
 
 
228 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3538  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  22.88 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3795  class II aldolase/adducin family protein  23.81 
 
 
228 aa  42.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.114454  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1978  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.12 
 
 
231 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000786518  normal  0.0917284 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1910  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  26.06 
 
 
231 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00106894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0065  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  22.88 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4759  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  24.83 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3596  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  22.88 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000129105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0063  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  22.88 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0680364  normal  0.805869 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04027  hypothetical protein  23.81 
 
 
228 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00063  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  22.88 
 
 
231 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1996  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.12 
 
 
231 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000658884  unclonable  0.0000198726 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2065  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.12 
 
 
231 aa  42.4  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000152307  hitchhiker  0.00000244495 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4669  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  23.81 
 
 
228 aa  42.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0470  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  27.56 
 
 
233 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1381  class II aldolase/adducin family protein  31.46 
 
 
232 aa  42.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0497618  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0066  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  22.88 
 
 
231 aa  42.4  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00062  hypothetical protein  22.88 
 
 
231 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>