217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3996 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3996  putative RNA methylase  100 
 
 		 317 aa  587  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4137  putative RNA methylase  90.82 
 
 		 317 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4111  putative RNA methylase  90.19 
 
 		 317 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0430  putative RNA methylase  78.96 
 
 		 314 aa  374  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2415  putative RNA methylase  34.59 
 
 		 373 aa  158  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0460836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  40 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  38.33 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000218402  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  36.09 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  41.1 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  36.09 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  39.66 
 
 		 399 aa  153  5e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.96 
 
 		 749 aa  152  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0018  putative RNA methylase  37.43 
 
 		 370 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000217625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  34.8 
 
 		 393 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2378  putative RNA methylase  34.7 
 
 		 399 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74505  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0282  putative RNA methylase:THUMP  38.33 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377639  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  42.86 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1081  N6-adenine-specific DNA methylase  31.88 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2967  putative RNA methylase  33.58 
 
 		 419 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0303  hypothetical protein  32.62 
 
 		 384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00482447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  32.16 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2577  putative RNA methylase  41.53 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.274965  hitchhiker  0.00000225035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  39.91 
 
 		 380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03361  RNA methylase family protein  39.15 
 
 		 374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4151  putative RNA methylase  39.15 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.949301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  40.85 
 
 		 391 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2005  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.17 
 
 		 701 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.391349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  32.53 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  38.29 
 
 		 393 aa  142  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2429  putative RNA methylase  28.38 
 
 		 384 aa  142  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.365067  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1378  N6-adenine-specific DNA methylase  34.05 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2256  N6-adenine-specific DNA methylase  32.59 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00159755  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1265  THUMP domain-containing protein  38.13 
 
 		 430 aa  140  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4180  putative RNA methylase  39.71 
 
 		 440 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2939  putative RNA methylase  28.49 
 
 		 390 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000322588  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0282  hypothetical protein  33.33 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.439028  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1739  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.07 
 
 		 721 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.876202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0265  putative RNA methylase  40.95 
 
 		 375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3084  putative RNA methylase  32.27 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2374  THUMP domain-containing protein  37.74 
 
 		 430 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3387  N6-adenine-specific DNA methylase  37.74 
 
 		 430 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0288  THUMP domain-containing protein  37.74 
 
 		 430 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1150  THUMP domain-containing protein  37.74 
 
 		 430 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3344  THUMP domain-containing protein  37.74 
 
 		 430 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3378  THUMP domain-containing protein  37.74 
 
 		 430 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.270297  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2557  THUMP domain-containing protein  37.74 
 
 		 430 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1816  N6-adenine-specific DNA methylase  34.65 
 
 		 384 aa  139  8.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0979861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2677  putative RNA methylase  38.19 
 
 		 432 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0623  putative RNA methylase  38.19 
 
 		 432 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.24 
 
 		 712 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  36.32 
 
 		 382 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2828  putative RNA methylase:THUMP  33.33 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0422  putative RNA methylase  37.3 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3727  hypothetical protein  35.87 
 
 		 379 aa  136  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00339425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.68 
 
 		 711 aa  136  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.58 
 
 		 709 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.58 
 
 		 709 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1690  hypothetical protein  35.27 
 
 		 381 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1468  hypothetical protein  35.71 
 
 		 379 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1440  methyltransferase  35.71 
 
 		 379 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1441  methyltransferase  35.71 
 
 		 379 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00219601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1584  hypothetical protein  35.71 
 
 		 379 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00510  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  35.62 
 
 		 729 aa  135  7.000000000000001e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.563195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1654  hypothetical protein  35.71 
 
 		 379 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0207358 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1729  hypothetical protein  35.71 
 
 		 379 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1484  putative RNA methylase  35.27 
 
 		 379 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140153  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.58 
 
 		 709 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000568014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1617  hypothetical protein  35.43 
 
 		 379 aa  135  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.595181  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1015  hypothetical protein  26.16 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.842194  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.58 
 
 		 709 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  39.15 
 
 		 374 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0925  putative RNA methylase  31.03 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.44 
 
 		 713 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.44 
 
 		 713 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1764  putative RNA methylase  42.03 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0339  putative RNA methylase  36.65 
 
 		 437 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.179905  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0579  putative RNA methylase  40.23 
 
 		 430 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  35.17 
 
 		 375 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1282  putative RNA methylase  34.38 
 
 		 379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0473  putative RNA methylase  36.51 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  37.87 
 
 		 380 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  33.58 
 
 		 709 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0598  putative RNA methylase  37.4 
 
 		 432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116947  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0350  putative RNA methylase  36.65 
 
 		 440 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1763  putative RNA methylase  34.08 
 
 		 371 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1095  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.44 
 
 		 708 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0184189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.92 
 
 		 699 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08600  putative RNA methylase  32.89 
 
 		 379 aa  133  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37 
 
 		 713 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1791  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.74 
 
 		 705 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37 
 
 		 711 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2424  N6-adenine-specific DNA methylase  38.84 
 
 		 398 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4012  putative RNA methylase  37.75 
 
 		 387 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1816  methyltransferase, putative  25.49 
 
 		 375 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.961633  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1020  N6-adenine-specific DNA methylase  33.04 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  31.42 
 
 		 377 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3795  putative RNA methylase  37.21 
 
 		 433 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02337  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.5 
 
 		 707 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.81 
 
 		 711 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0224  putative RNA methylase  36.82 
 
 		 434 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>