More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1548 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1548  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
420 aa  832    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.751317  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1084  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.01 
 
 
426 aa  551  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.16 
 
 
427 aa  425  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.72 
 
 
427 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0413  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.22 
 
 
431 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399966  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.95 
 
 
432 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.836596  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.16 
 
 
421 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3876  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.49 
 
 
427 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0207983 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  57.61 
 
 
427 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0060  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.03 
 
 
425 aa  419  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3094  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.44 
 
 
432 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.17 
 
 
424 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3011  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.29 
 
 
427 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61903  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2868  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.44 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2669  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.66 
 
 
418 aa  417  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4200  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.16 
 
 
427 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672348  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0444  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.57 
 
 
430 aa  412  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.312195  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0159  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.16 
 
 
430 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0103  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.22 
 
 
432 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.994876 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0581  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.85 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.154304  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3456  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.04 
 
 
428 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3824  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.91 
 
 
420 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1056  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.59 
 
 
427 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3516  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.64 
 
 
420 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4717  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.16 
 
 
424 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.144444 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3804  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.1 
 
 
420 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4728  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.22 
 
 
431 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1469  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.45 
 
 
421 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300791  normal  0.0287865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2337  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.47 
 
 
429 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247409  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0161  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.66 
 
 
433 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.310719  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0571  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.66 
 
 
430 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154303  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4218  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.25 
 
 
431 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0319  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
412 aa  390  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0419  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.79 
 
 
429 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.602103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0520  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.57 
 
 
430 aa  388  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121097  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2058  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.5 
 
 
457 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.498177  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.66 
 
 
418 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0253  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.57 
 
 
430 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1205  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.72 
 
 
434 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906514  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4503  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.72 
 
 
423 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
422 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1382  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.46 
 
 
415 aa  372  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.11 
 
 
414 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.48 
 
 
418 aa  359  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.07 
 
 
418 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.66 
 
 
418 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3276  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.83 
 
 
429 aa  354  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295726 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.4 
 
 
419 aa  354  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.81 
 
 
418 aa  353  2.9999999999999997e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.42 
 
 
418 aa  353  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.93 
 
 
418 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.45 
 
 
415 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.9 
 
 
418 aa  351  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.91 
 
 
432 aa  352  1e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  43.51 
 
 
419 aa  347  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.69 
 
 
420 aa  347  3e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.85 
 
 
421 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.77 
 
 
418 aa  344  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.04 
 
 
418 aa  342  9e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.73 
 
 
417 aa  341  1e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.61 
 
 
421 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.45 
 
 
419 aa  340  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.55 
 
 
418 aa  339  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.61 
 
 
423 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.25 
 
 
419 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.88 
 
 
423 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.5 
 
 
424 aa  338  8e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.77 
 
 
434 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  45.85 
 
 
423 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.63 
 
 
423 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.26 
 
 
410 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.24 
 
 
418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.87 
 
 
423 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.65 
 
 
418 aa  336  5e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.65 
 
 
418 aa  336  5e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.79 
 
 
418 aa  335  7e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.94 
 
 
421 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.94 
 
 
417 aa  335  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.75 
 
 
418 aa  333  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.72 
 
 
418 aa  334  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.25 
 
 
416 aa  334  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.53 
 
 
418 aa  333  3e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0322  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.72 
 
 
433 aa  333  3e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930114  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.84 
 
 
430 aa  332  6e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0293  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.11 
 
 
433 aa  332  6e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00187024  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.9 
 
 
435 aa  332  7.000000000000001e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6814  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.26 
 
 
415 aa  331  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0152004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  46.19 
 
 
429 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.15 
 
 
424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.01 
 
 
425 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.41 
 
 
418 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.9 
 
 
427 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2884  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.37 
 
 
428 aa  329  6e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.82 
 
 
425 aa  328  8e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0081  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.73 
 
 
415 aa  328  9e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.01 
 
 
418 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.05 
 
 
415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.64 
 
 
415 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.15 
 
 
415 aa  326  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.61 
 
 
411 aa  326  5e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>