More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0161 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0444  gamma-glutamyl phosphate reductase  76.27 
 
 		 430 aa  655    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.312195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0161  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 433 aa  858    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.310719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0159  gamma-glutamyl phosphate reductase  79.72 
 
 		 430 aa  666    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0419  gamma-glutamyl phosphate reductase  78.52 
 
 		 429 aa  633  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.602103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0520  gamma-glutamyl phosphate reductase  78.34 
 
 		 430 aa  628  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121097  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0571  gamma-glutamyl phosphate reductase  79.49 
 
 		 430 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0253  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.88 
 
 		 430 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0413  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.64 
 
 		 431 aa  536  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399966  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.06 
 
 		 427 aa  537  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3876  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.59 
 
 		 427 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0207983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2058  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.57 
 
 		 457 aa  533  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.498177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.07 
 
 		 424 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4200  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.18 
 
 		 427 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3011  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.69 
 
 		 427 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.56 
 
 		 427 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.59 
 
 		 421 aa  509  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3094  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.56 
 
 		 432 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0103  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.98 
 
 		 432 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.994876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3456  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.07 
 
 		 428 aa  507  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.3 
 
 		 432 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.836596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2868  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.56 
 
 		 432 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1056  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.09 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3276  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.24 
 
 		 429 aa  491  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4218  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.25 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4728  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.65 
 
 		 431 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  60.29 
 
 		 427 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0319  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.61 
 
 		 412 aa  458  1e-127  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2337  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.88 
 
 		 429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247409  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0060  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.6 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0581  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.45 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.154304  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4717  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.24 
 
 		 424 aa  445  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.144444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2669  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.49 
 
 		 418 aa  435  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.59 
 
 		 422 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1469  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.46 
 
 		 421 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300791  normal  0.0287865 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1205  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.33 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3804  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.19 
 
 		 420 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.18 
 
 		 418 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3824  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.8 
 
 		 420 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3516  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.8 
 
 		 420 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1084  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.6 
 
 		 426 aa  411  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4503  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.31 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.6 
 
 		 421 aa  396  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1382  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.08 
 
 		 415 aa  390  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.23 
 
 		 418 aa  388  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.18 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1548  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.88 
 
 		 420 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.751317  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.56 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.56 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.84 
 
 		 420 aa  383  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.73 
 
 		 421 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.66 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.72 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.15 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.32 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.83 
 
 		 418 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.49 
 
 		 421 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.73 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.06 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.91 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.06 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.91 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.44 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.74 
 
 		 419 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 		 423 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.73 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.5 
 
 		 414 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.06 
 
 		 435 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.99 
 
 		 418 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.68 
 
 		 418 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.2 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.2 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.2 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.6 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.28 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.2 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.2 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.2 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.08 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.96 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.07 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.87 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 		 426 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.06 
 
 		 421 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 		 430 aa  363  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.06 
 
 		 421 aa  363  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.94 
 
 		 426 aa  363  2e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.08 
 
 		 421 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0528  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.18 
 
 		 429 aa  363  2e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.15 
 
 		 415 aa  363  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.04 
 
 		 418 aa  363  4e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 419 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.06 
 
 		 429 aa  362  8e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.93 
 
 		 418 aa  361  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.2 
 
 		 429 aa  361  1e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.95 
 
 		 426 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.96 
 
 		 423 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>