More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3199 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  88.01 
 
 
418 aa  738    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
418 aa  854    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  79.62 
 
 
418 aa  696    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  78.9 
 
 
418 aa  693    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  78.42 
 
 
418 aa  670    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.99 
 
 
418 aa  671    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  85.37 
 
 
418 aa  738    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  69.62 
 
 
418 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.96 
 
 
418 aa  518  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.32 
 
 
416 aa  492  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.74 
 
 
418 aa  488  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.53 
 
 
414 aa  481  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.21 
 
 
418 aa  474  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.42 
 
 
423 aa  474  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.85 
 
 
434 aa  471  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.49 
 
 
419 aa  474  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.04 
 
 
414 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.21 
 
 
419 aa  465  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.67 
 
 
419 aa  462  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.15 
 
 
418 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.63 
 
 
430 aa  455  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.64 
 
 
419 aa  457  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.49 
 
 
427 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.88 
 
 
421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.87 
 
 
418 aa  450  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0431  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.55 
 
 
448 aa  442  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.65 
 
 
416 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.63 
 
 
446 aa  444  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0321  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.96 
 
 
435 aa  443  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155357  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  55.64 
 
 
423 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.8 
 
 
416 aa  439  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.25 
 
 
415 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.25 
 
 
415 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.8 
 
 
418 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.46 
 
 
418 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0441  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.66 
 
 
423 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0291  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.07 
 
 
425 aa  435  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000393853  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 
415 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.43 
 
 
420 aa  438  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.63 
 
 
415 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0151  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 
420 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3942  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.58 
 
 
415 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.08 
 
 
417 aa  428  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.96 
 
 
456 aa  429  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3849  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.58 
 
 
415 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4057  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.58 
 
 
415 aa  431  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.65 
 
 
423 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.35 
 
 
417 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.49 
 
 
418 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0762  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.21 
 
 
415 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.17 
 
 
423 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.44 
 
 
421 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.15 
 
 
411 aa  422  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.62 
 
 
421 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1215  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.82 
 
 
419 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.41 
 
 
435 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.09 
 
 
421 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  53.16 
 
 
428 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
423 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3015  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.85 
 
 
415 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.08 
 
 
418 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
425 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.17 
 
 
423 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1633  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.31 
 
 
419 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565136  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2672  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.07 
 
 
424 aa  418  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322038  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.29 
 
 
419 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.04 
 
 
418 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.17 
 
 
423 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.37 
 
 
420 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.88 
 
 
424 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.23 
 
 
423 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0612  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.63 
 
 
436 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642668 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0081  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.61 
 
 
415 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.17 
 
 
423 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4145  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.16 
 
 
413 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.17 
 
 
435 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.35 
 
 
423 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.63 
 
 
424 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.9 
 
 
424 aa  409  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.1 
 
 
423 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.73 
 
 
421 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.73 
 
 
421 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.08 
 
 
418 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.87 
 
 
426 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.07 
 
 
418 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.04 
 
 
427 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.07 
 
 
418 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.81 
 
 
421 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.21 
 
 
425 aa  410  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.63 
 
 
426 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.33 
 
 
426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1503  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.59 
 
 
419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690049  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.8 
 
 
421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.17 
 
 
415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4285  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.42 
 
 
415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.35 
 
 
435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0115  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.42 
 
 
415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 
419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.72 
 
 
430 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>