More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1238 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 427 aa  849    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.34 
 
 		 427 aa  511  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0413  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.16 
 
 		 431 aa  509  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399966  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3011  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.1 
 
 		 427 aa  501  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3456  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.95 
 
 		 428 aa  498  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3876  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.05 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0207983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0159  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.45 
 
 		 430 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4200  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.29 
 
 		 427 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0444  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.24 
 
 		 430 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.312195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  61 
 
 		 424 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2058  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.88 
 
 		 457 aa  491  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.498177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1205  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.19 
 
 		 434 aa  491  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2868  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.25 
 
 		 432 aa  490  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.01 
 
 		 432 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.836596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.19 
 
 		 427 aa  490  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3094  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.01 
 
 		 432 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.95 
 
 		 421 aa  487  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0419  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.72 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.602103 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0581  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.23 
 
 		 429 aa  485  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.154304  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0520  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.68 
 
 		 430 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121097  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1084  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.5 
 
 		 426 aa  484  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1056  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.76 
 
 		 427 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.09 
 
 		 422 aa  481  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0571  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.2 
 
 		 430 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0103  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.4 
 
 		 432 aa  475  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.994876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0253  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.53 
 
 		 430 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3276  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.31 
 
 		 429 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4728  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.97 
 
 		 431 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.49 
 
 		 418 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0060  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.43 
 
 		 425 aa  467  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0161  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.27 
 
 		 433 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.310719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2669  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.23 
 
 		 418 aa  466  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4218  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.36 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2337  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.65 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247409  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.85 
 
 		 420 aa  464  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1469  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.34 
 
 		 421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300791  normal  0.0287865 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.28 
 
 		 427 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4717  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.05 
 
 		 424 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.144444 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.24 
 
 		 435 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  54.39 
 
 		 423 aa  448  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.09 
 
 		 421 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.01 
 
 		 418 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3824  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.76 
 
 		 420 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3516  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.76 
 
 		 420 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3804  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.78 
 
 		 420 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.83 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.83 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.84 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.81 
 
 		 418 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.34 
 
 		 423 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0319  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.2 
 
 		 412 aa  434  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.55 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.92 
 
 		 423 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.42 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.11 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.07 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0293  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.51 
 
 		 433 aa  428  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00187024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.44 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.98 
 
 		 419 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.59 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.35 
 
 		 423 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.66 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.68 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.85 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.4 
 
 		 429 aa  421  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.66 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0322  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.81 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.39 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.66 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.66 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.66 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.19 
 
 		 435 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1382  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.29 
 
 		 415 aa  424  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.39 
 
 		 423 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.44 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.31 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.01 
 
 		 429 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4503  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.24 
 
 		 423 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.22 
 
 		 424 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.81 
 
 		 418 aa  418  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.2 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.87 
 
 		 423 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.66 
 
 		 425 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.44 
 
 		 426 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.92 
 
 		 423 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.34 
 
 		 421 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.21 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.26 
 
 		 418 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.79 
 
 		 421 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.74 
 
 		 418 aa  411  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.22 
 
 		 421 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.21 
 
 		 421 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.64 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.1 
 
 		 418 aa  409  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.92 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.96 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.66 
 
 		 419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1548  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.04 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.751317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>