More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1084 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1084  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
426 aa  842    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1548  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.05 
 
 
420 aa  526  1e-148  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.751317  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.48 
 
 
427 aa  475  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  63.59 
 
 
427 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.28 
 
 
421 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0413  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.77 
 
 
431 aa  465  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399966  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.73 
 
 
427 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.84 
 
 
424 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3876  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.14 
 
 
427 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0207983 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3011  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.97 
 
 
427 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61903  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4200  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.9 
 
 
427 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672348  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1056  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.5 
 
 
427 aa  449  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0444  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.14 
 
 
430 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.312195  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.16 
 
 
432 aa  443  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.836596  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2669  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.76 
 
 
418 aa  442  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0060  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.44 
 
 
425 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0159  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.29 
 
 
430 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3094  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.16 
 
 
432 aa  435  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0319  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.03 
 
 
412 aa  432  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3456  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.69 
 
 
428 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2868  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.91 
 
 
432 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0520  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.38 
 
 
430 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4717  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.24 
 
 
424 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.144444 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0581  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.98 
 
 
429 aa  431  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.154304  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2337  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.5 
 
 
429 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247409  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1205  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.57 
 
 
434 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906514  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0103  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.14 
 
 
432 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.994876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0253  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.28 
 
 
430 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0419  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.78 
 
 
429 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.602103 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1382  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.23 
 
 
415 aa  418  9.999999999999999e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0571  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.33 
 
 
430 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154303  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4728  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.48 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3804  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.18 
 
 
420 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.37 
 
 
414 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4218  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.93 
 
 
431 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1469  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.87 
 
 
421 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300791  normal  0.0287865 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3824  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.53 
 
 
420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2058  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.07 
 
 
457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.498177  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0161  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.35 
 
 
433 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.310719  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3516  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.53 
 
 
420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.35 
 
 
418 aa  401  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3276  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.08 
 
 
429 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295726 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4503  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.92 
 
 
423 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.19 
 
 
422 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.51 
 
 
418 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.15 
 
 
419 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 
421 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.33 
 
 
421 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 
418 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.77 
 
 
410 aa  384  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.47 
 
 
418 aa  384  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.97 
 
 
415 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.8 
 
 
420 aa  383  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.52 
 
 
423 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.25 
 
 
430 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.04 
 
 
423 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.45 
 
 
418 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.47 
 
 
421 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.48 
 
 
415 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.12 
 
 
429 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.17 
 
 
423 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.83 
 
 
418 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.07 
 
 
427 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.74 
 
 
418 aa  378  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0528  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.9 
 
 
429 aa  374  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.42 
 
 
418 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.47 
 
 
435 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.87 
 
 
423 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.52 
 
 
423 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.04 
 
 
423 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.37 
 
 
419 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
423 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.1 
 
 
418 aa  372  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  45 
 
 
432 aa  370  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.21 
 
 
418 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.97 
 
 
418 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.48 
 
 
418 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.65 
 
 
434 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.63 
 
 
423 aa  365  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.15 
 
 
424 aa  365  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.8 
 
 
419 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.82 
 
 
419 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3751  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.14 
 
 
430 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.3 
 
 
416 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.91 
 
 
418 aa  364  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.91 
 
 
418 aa  364  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.63 
 
 
458 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.63 
 
 
458 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.63 
 
 
458 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.63 
 
 
458 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.83 
 
 
418 aa  363  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.63 
 
 
458 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  46.34 
 
 
423 aa  363  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.8 
 
 
425 aa  363  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.17 
 
 
423 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.39 
 
 
423 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 
423 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.74 
 
 
419 aa  362  5.0000000000000005e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.5 
 
 
418 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.72 
 
 
419 aa  361  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>