More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0792 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
410 aa  830    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.37 
 
 
411 aa  556  1e-157  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.94 
 
 
418 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0634  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.22 
 
 
407 aa  428  1e-119  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1319  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.27 
 
 
407 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.88 
 
 
414 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.64 
 
 
419 aa  414  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.58 
 
 
415 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.02 
 
 
421 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.83 
 
 
415 aa  409  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.73 
 
 
419 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.18 
 
 
420 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.29 
 
 
421 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.2 
 
 
418 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.09 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.52 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.03 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.61 
 
 
418 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.58 
 
 
434 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.03 
 
 
418 aa  396  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.45 
 
 
418 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.15 
 
 
418 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.99 
 
 
418 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.07 
 
 
429 aa  393  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.87 
 
 
419 aa  392  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.41 
 
 
418 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 
419 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.47 
 
 
418 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.32 
 
 
423 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.18 
 
 
430 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.59 
 
 
423 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.83 
 
 
415 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0151  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.23 
 
 
420 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3084  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.1 
 
 
421 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.54 
 
 
415 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.59 
 
 
423 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.29 
 
 
423 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4145  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.84 
 
 
413 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.04 
 
 
415 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.63 
 
 
417 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.41 
 
 
423 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.07 
 
 
423 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.81 
 
 
418 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0936  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.3 
 
 
417 aa  381  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3942  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  46.91 
 
 
415 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.55 
 
 
416 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.44 
 
 
418 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4057  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  46.91 
 
 
415 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.5 
 
 
415 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.92 
 
 
424 aa  376  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.15 
 
 
425 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.39 
 
 
421 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0528  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.37 
 
 
429 aa  376  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.45 
 
 
420 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3287  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.58 
 
 
419 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3849  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  46.42 
 
 
415 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3149  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.58 
 
 
419 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485003  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.63 
 
 
424 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.9 
 
 
427 aa  375  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3300  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.58 
 
 
419 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00136137  normal  0.0296518 
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.9 
 
 
421 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.52 
 
 
416 aa  373  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.59 
 
 
427 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.59 
 
 
435 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0901  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.1 
 
 
417 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.76 
 
 
427 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0762  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.79 
 
 
415 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.86 
 
 
417 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0968  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.86 
 
 
417 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1084  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.55 
 
 
426 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.84 
 
 
417 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  43.84 
 
 
417 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.96 
 
 
418 aa  368  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.5 
 
 
418 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.5 
 
 
418 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.25 
 
 
418 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.99 
 
 
414 aa  371  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.28 
 
 
426 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.21 
 
 
421 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.04 
 
 
426 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.21 
 
 
421 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.94 
 
 
424 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.6 
 
 
417 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0293  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.48 
 
 
433 aa  367  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00187024  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.75 
 
 
416 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.86 
 
 
415 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.99 
 
 
432 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4285  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.32 
 
 
415 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0081  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.79 
 
 
415 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0115  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.32 
 
 
415 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3015  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.23 
 
 
415 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.84 
 
 
421 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4425  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.57 
 
 
415 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  45.74 
 
 
428 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.23 
 
 
417 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0297  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.84 
 
 
417 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.75 
 
 
416 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2594  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.64 
 
 
432 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.75 
 
 
416 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3338  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.6 
 
 
417 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>