More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2600 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
415 aa  846    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.21 
 
 
414 aa  501  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.94 
 
 
419 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.25 
 
 
415 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.77 
 
 
415 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.74 
 
 
418 aa  488  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.72 
 
 
418 aa  474  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.62 
 
 
415 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  53.51 
 
 
419 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.68 
 
 
419 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.38 
 
 
415 aa  456  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.86 
 
 
415 aa  455  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2873  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.66 
 
 
413 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3028  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.62 
 
 
415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00693675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.9 
 
 
415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.14 
 
 
415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.81 
 
 
419 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.14 
 
 
415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.28 
 
 
416 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.66 
 
 
415 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.17 
 
 
413 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.03 
 
 
414 aa  448  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1716  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.01 
 
 
413 aa  451  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0284  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.77 
 
 
417 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2781  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.9 
 
 
414 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2992  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.9 
 
 
414 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.440021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2252  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.07 
 
 
415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.628785  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.52 
 
 
420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.33 
 
 
418 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2993  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.83 
 
 
415 aa  442  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471186  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.46 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.5 
 
 
417 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.98 
 
 
421 aa  435  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.08 
 
 
415 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.97 
 
 
418 aa  435  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.75 
 
 
416 aa  436  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.5 
 
 
418 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 
418 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3197  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.52 
 
 
434 aa  431  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.97 
 
 
418 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.55 
 
 
418 aa  428  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.13 
 
 
418 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.06 
 
 
418 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.15 
 
 
420 aa  430  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.33 
 
 
418 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.69 
 
 
415 aa  426  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.82 
 
 
418 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1645  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
431 aa  418  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  hitchhiker  0.00108459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1227  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.92 
 
 
419 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.683793  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.51 
 
 
418 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 
418 aa  415  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.77 
 
 
418 aa  412  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.53 
 
 
418 aa  412  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7264  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.64 
 
 
419 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
445 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1268  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.94 
 
 
409 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0385  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.52 
 
 
413 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.427307  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1818  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.25 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0299965  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11440  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.28 
 
 
446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180187 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.65 
 
 
424 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.28 
 
 
418 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2141  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.42 
 
 
459 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000141215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.94 
 
 
416 aa  403  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.33 
 
 
423 aa  404  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.53 
 
 
418 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.06 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.53 
 
 
418 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.49 
 
 
423 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2279  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.47 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0615198  hitchhiker  0.00168342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2813  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.13 
 
 
424 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0167812  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 
419 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.1 
 
 
427 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1507  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.55 
 
 
448 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0477436  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1194  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.88 
 
 
420 aa  398  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5256  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.21 
 
 
418 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.15 
 
 
429 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.36 
 
 
446 aa  395  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1018  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.69 
 
 
425 aa  395  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0936  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.75 
 
 
417 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.8 
 
 
415 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.54 
 
 
424 aa  394  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.51 
 
 
425 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.29 
 
 
424 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 
416 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0784  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.54 
 
 
423 aa  394  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0901  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.36 
 
 
417 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.2 
 
 
416 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12455  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.5 
 
 
415 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.440889 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.29 
 
 
425 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  46.23 
 
 
428 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.49 
 
 
423 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.93 
 
 
416 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.89 
 
 
423 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2884  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
428 aa  393  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0456  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.49 
 
 
413 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2387  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 
450 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0346385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3934  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.26 
 
 
415 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.2 
 
 
416 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.89 
 
 
423 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.65 
 
 
423 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>