More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2276 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
427 aa  863    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.19 
 
 
434 aa  627  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  71.39 
 
 
418 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.57 
 
 
418 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  69.54 
 
 
421 aa  604  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.17 
 
 
420 aa  597  1e-169  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  71.81 
 
 
430 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.65 
 
 
423 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.01 
 
 
423 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  69.78 
 
 
428 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.41 
 
 
421 aa  568  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  69.83 
 
 
421 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.69 
 
 
435 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.2 
 
 
458 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.77 
 
 
423 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  69.76 
 
 
421 aa  563  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.83 
 
 
429 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.2 
 
 
458 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.54 
 
 
423 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.2 
 
 
458 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  69.6 
 
 
421 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.2 
 
 
458 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.38 
 
 
423 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.14 
 
 
423 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.45 
 
 
435 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.2 
 
 
458 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.98 
 
 
423 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.64 
 
 
426 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.75 
 
 
423 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.29 
 
 
435 aa  557  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.64 
 
 
426 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.83 
 
 
423 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.92 
 
 
421 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.14 
 
 
418 aa  553  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.67 
 
 
425 aa  553  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.3 
 
 
423 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.03 
 
 
432 aa  553  1e-156  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.35 
 
 
423 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.4 
 
 
426 aa  549  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.71 
 
 
421 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.75 
 
 
426 aa  549  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.3 
 
 
423 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.11 
 
 
423 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.43 
 
 
419 aa  543  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.35 
 
 
426 aa  544  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.78 
 
 
424 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.68 
 
 
423 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.06 
 
 
423 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.06 
 
 
419 aa  539  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.59 
 
 
423 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.93 
 
 
426 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.78 
 
 
425 aa  529  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0293  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.05 
 
 
433 aa  523  1e-147  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00187024  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.91 
 
 
418 aa  521  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.91 
 
 
418 aa  521  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0322  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.81 
 
 
433 aa  519  1e-146  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930114  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.14 
 
 
429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  58.25 
 
 
423 aa  504  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4545  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.24 
 
 
426 aa  501  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4584  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.29 
 
 
436 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0963  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.24 
 
 
437 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0723541  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3751  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.41 
 
 
430 aa  491  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3262  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.19 
 
 
426 aa  490  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960329  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.55 
 
 
418 aa  489  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.09 
 
 
444 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0257  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.53 
 
 
425 aa  489  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3913  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.19 
 
 
426 aa  491  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.9 
 
 
418 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0269  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.5 
 
 
429 aa  482  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303722  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.81 
 
 
437 aa  478  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.71 
 
 
418 aa  479  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6000  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.41 
 
 
426 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0137203 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.12 
 
 
418 aa  472  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.94 
 
 
418 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.75 
 
 
416 aa  462  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4007  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.07 
 
 
439 aa  461  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000305093 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.05 
 
 
418 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.37 
 
 
418 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.17 
 
 
418 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.77 
 
 
418 aa  448  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.73 
 
 
418 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.66 
 
 
418 aa  449  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.77 
 
 
418 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  57.28 
 
 
427 aa  443  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.51 
 
 
419 aa  443  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.41 
 
 
417 aa  439  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.22 
 
 
419 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.82 
 
 
427 aa  434  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.9 
 
 
419 aa  431  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
415 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.84 
 
 
421 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.82 
 
 
446 aa  426  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.45 
 
 
456 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.13 
 
 
414 aa  425  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0581  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.72 
 
 
429 aa  426  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.154304  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.75 
 
 
416 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 
416 aa  422  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.8 
 
 
427 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1056  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.87 
 
 
427 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.42 
 
 
422 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>