More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1870 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
419 aa  843    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.56 
 
 
418 aa  583  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  69.54 
 
 
419 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  63.48 
 
 
419 aa  548  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.94 
 
 
418 aa  544  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.66 
 
 
414 aa  524  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.04 
 
 
419 aa  509  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.63 
 
 
415 aa  502  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.11 
 
 
415 aa  504  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.52 
 
 
418 aa  490  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.48 
 
 
415 aa  481  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.49 
 
 
418 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.69 
 
 
418 aa  478  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.6 
 
 
417 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.69 
 
 
418 aa  479  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.44 
 
 
418 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.05 
 
 
418 aa  471  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.05 
 
 
418 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.72 
 
 
415 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.05 
 
 
416 aa  471  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.81 
 
 
415 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3028  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.72 
 
 
415 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00693675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.99 
 
 
415 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.25 
 
 
418 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.99 
 
 
415 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.53 
 
 
415 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.72 
 
 
415 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.47 
 
 
415 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.53 
 
 
415 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.05 
 
 
418 aa  464  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.74 
 
 
430 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.5 
 
 
415 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.56 
 
 
425 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.59 
 
 
424 aa  456  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.92 
 
 
413 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2781  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.5 
 
 
414 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2992  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.5 
 
 
414 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.440021  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.5 
 
 
424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2873  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.47 
 
 
413 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.42 
 
 
421 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.24 
 
 
421 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.58 
 
 
414 aa  448  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.7 
 
 
420 aa  448  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2252  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.99 
 
 
415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.628785  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.31 
 
 
420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.06 
 
 
418 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2993  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.23 
 
 
415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471186  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.6 
 
 
418 aa  442  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.04 
 
 
446 aa  442  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.22 
 
 
416 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.2 
 
 
418 aa  444  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.19 
 
 
421 aa  435  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.34 
 
 
427 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.34 
 
 
418 aa  436  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2884  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.37 
 
 
428 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.43 
 
 
434 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.96 
 
 
423 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.22 
 
 
421 aa  434  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.28 
 
 
435 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.84 
 
 
418 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.23 
 
 
418 aa  429  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.84 
 
 
418 aa  431  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.69 
 
 
419 aa  428  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.83 
 
 
419 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1716  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.09 
 
 
413 aa  429  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.59 
 
 
418 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.59 
 
 
418 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.74 
 
 
423 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.55 
 
 
425 aa  428  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2672  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.98 
 
 
424 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322038  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.36 
 
 
411 aa  422  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.09 
 
 
429 aa  424  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0385  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.53 
 
 
413 aa  421  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.427307  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.68 
 
 
430 aa  423  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.03 
 
 
423 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.22 
 
 
421 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 
435 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.55 
 
 
423 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.22 
 
 
423 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
423 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.6 
 
 
410 aa  421  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  55.91 
 
 
428 aa  418  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.22 
 
 
421 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.79 
 
 
423 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.11 
 
 
445 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.42 
 
 
432 aa  419  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 
423 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1194  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.7 
 
 
420 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1268  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  54.8 
 
 
409 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
423 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.3 
 
 
456 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
423 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.48 
 
 
416 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.22 
 
 
426 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
423 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.14 
 
 
426 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.52 
 
 
423 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0456  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.53 
 
 
413 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.52 
 
 
435 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.98 
 
 
426 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>