More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1469 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3804  gamma-glutamyl phosphate reductase  78.95 
 
 		 420 aa  634    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1469  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 421 aa  838    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300791  normal  0.0287865 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3516  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.57 
 
 		 420 aa  618  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3824  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.27 
 
 		 420 aa  615  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.16 
 
 		 422 aa  617  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1205  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.87 
 
 		 434 aa  612  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4503  gamma-glutamyl phosphate reductase  71.09 
 
 		 423 aa  554  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.59 
 
 		 421 aa  511  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.59 
 
 		 427 aa  514  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3011  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.59 
 
 		 427 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1056  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.07 
 
 		 427 aa  501  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.38 
 
 		 424 aa  495  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.02 
 
 		 427 aa  495  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4200  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.63 
 
 		 427 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3876  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.15 
 
 		 427 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0207983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0413  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.71 
 
 		 431 aa  474  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399966  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0444  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.33 
 
 		 430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.312195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3456  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.67 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0159  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.13 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  60.34 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0419  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.85 
 
 		 429 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.602103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0571  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.61 
 
 		 430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0520  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.05 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121097  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0319  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.34 
 
 		 412 aa  440  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0581  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.35 
 
 		 429 aa  437  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.154304  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2058  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.33 
 
 		 457 aa  433  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.498177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2337  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.62 
 
 		 429 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247409  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0253  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.13 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0103  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.17 
 
 		 432 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.994876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.61 
 
 		 418 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0161  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.74 
 
 		 433 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.310719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4218  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.51 
 
 		 431 aa  421  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3276  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.95 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.24 
 
 		 432 aa  418  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.836596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3094  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.21 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2868  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.21 
 
 		 432 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1084  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.33 
 
 		 426 aa  413  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.6 
 
 		 421 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.64 
 
 		 420 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4728  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.31 
 
 		 431 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.46 
 
 		 421 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.46 
 
 		 421 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0060  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.33 
 
 		 425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 418 aa  403  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.93 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.08 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.01 
 
 		 418 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4717  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.16 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.144444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2669  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.24 
 
 		 418 aa  399  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.44 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.71 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.52 
 
 		 418 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.93 
 
 		 423 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1382  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.08 
 
 		 415 aa  392  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.86 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.16 
 
 		 421 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.6 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.9 
 
 		 423 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.6 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.2 
 
 		 423 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.16 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.45 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.08 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.45 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0293  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.31 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00187024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 425 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0322  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.42 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.35 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.08 
 
 		 421 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.36 
 
 		 418 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.6 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.47 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.22 
 
 		 418 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1548  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.45 
 
 		 420 aa  381  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.751317  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.52 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.3 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.53 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.93 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 		 428 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.06 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  43 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  43 
 
 		 415 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.69 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.38 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.45 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  43 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.49 
 
 		 415 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3028  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.49 
 
 		 415 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00693675  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.69 
 
 		 458 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.18 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.6 
 
 		 418 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.07 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.69 
 
 		 458 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.69 
 
 		 458 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.69 
 
 		 458 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0257  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.38 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.69 
 
 		 458 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>