More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2499 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 418 aa  850    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.41 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.5 
 
 		 427 aa  438  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  53 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.84 
 
 		 418 aa  435  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.38 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.4 
 
 		 434 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.39 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.42 
 
 		 420 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.24 
 
 		 418 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.98 
 
 		 418 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.21 
 
 		 421 aa  428  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.72 
 
 		 418 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  54 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.52 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.6 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.21 
 
 		 419 aa  425  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.52 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.26 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.6 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.59 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.45 
 
 		 416 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.6 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.37 
 
 		 426 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.18 
 
 		 446 aa  422  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.96 
 
 		 421 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.27 
 
 		 423 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.73 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.83 
 
 		 414 aa  423  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.59 
 
 		 421 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.78 
 
 		 423 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.54 
 
 		 421 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.67 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0528  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.96 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.74 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.61 
 
 		 419 aa  419  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.56 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.56 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.78 
 
 		 423 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.28 
 
 		 429 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.39 
 
 		 417 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.33 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.83 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.64 
 
 		 421 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.32 
 
 		 417 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.06 
 
 		 430 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.56 
 
 		 426 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.02 
 
 		 419 aa  412  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.82 
 
 		 421 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.53 
 
 		 415 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.64 
 
 		 421 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.23 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 		 415 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 415 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.59 
 
 		 423 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.12 
 
 		 425 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.99 
 
 		 423 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.04 
 
 		 419 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0269  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.55 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303722  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.73 
 
 		 418 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.42 
 
 		 426 aa  411  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 		 423 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.33 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.72 
 
 		 428 aa  408  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.9 
 
 		 426 aa  411  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.18 
 
 		 425 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.64 
 
 		 424 aa  408  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0257  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.44 
 
 		 425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.82 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.29 
 
 		 437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.35 
 
 		 423 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.99 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.35 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0963  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.16 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0723541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.65 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.07 
 
 		 411 aa  403  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.48 
 
 		 416 aa  402  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3094  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.81 
 
 		 432 aa  401  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.33 
 
 		 418 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.83 
 
 		 414 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.05 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.05 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.05 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.3 
 
 		 432 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.836596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.05 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  54.99 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.49 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2868  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.55 
 
 		 432 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.57 
 
 		 418 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.65 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.05 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.05 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.57 
 
 		 415 aa  398  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.27 
 
 		 421 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 427 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.82 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4584  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.792503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>