More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4280 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4200  gamma-glutamyl phosphate reductase  79.86 
 
 		 427 aa  684    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 427 aa  853    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3876  gamma-glutamyl phosphate reductase  80.09 
 
 		 427 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0207983 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3011  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.64 
 
 		 427 aa  647    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.56 
 
 		 427 aa  622  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.32 
 
 		 421 aa  620  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1056  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.77 
 
 		 427 aa  606  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3456  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.5 
 
 		 428 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0444  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.18 
 
 		 430 aa  557  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.312195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.98 
 
 		 424 aa  541  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0159  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.41 
 
 		 430 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0319  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.93 
 
 		 412 aa  523  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0413  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.39 
 
 		 431 aa  519  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399966  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2058  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.78 
 
 		 457 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.498177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3094  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.41 
 
 		 432 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0520  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.15 
 
 		 430 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121097  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0419  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.33 
 
 		 429 aa  511  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.602103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0253  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.7 
 
 		 430 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0571  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.06 
 
 		 430 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2868  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.17 
 
 		 432 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.85 
 
 		 432 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.836596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0161  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.56 
 
 		 433 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.310719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0103  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.17 
 
 		 432 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.994876 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3276  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.32 
 
 		 429 aa  496  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4218  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.68 
 
 		 431 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  61.34 
 
 		 427 aa  490  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4728  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.5 
 
 		 431 aa  487  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1205  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.62 
 
 		 434 aa  475  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1469  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.02 
 
 		 421 aa  471  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300791  normal  0.0287865 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.09 
 
 		 422 aa  473  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3804  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.3 
 
 		 420 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3824  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.43 
 
 		 420 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0060  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.43 
 
 		 425 aa  455  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3516  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.43 
 
 		 420 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0581  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.31 
 
 		 429 aa  454  1e-127  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.154304  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4503  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.02 
 
 		 423 aa  455  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1084  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.93 
 
 		 426 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4717  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.51 
 
 		 424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.144444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2337  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.38 
 
 		 429 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247409  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2669  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.1 
 
 		 418 aa  431  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.37 
 
 		 414 aa  420  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 		 418 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.07 
 
 		 420 aa  408  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.8 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 		 418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.52 
 
 		 421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.98 
 
 		 418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 		 418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1548  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.8 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.751317  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.83 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.68 
 
 		 418 aa  398  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1382  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.8 
 
 		 415 aa  399  9.999999999999999e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.03 
 
 		 419 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.32 
 
 		 418 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.23 
 
 		 415 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 421 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 421 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.07 
 
 		 418 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.51 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 418 aa  396  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.12 
 
 		 418 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.47 
 
 		 423 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.19 
 
 		 418 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.3 
 
 		 425 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.71 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.71 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.73 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 		 423 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.35 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 		 418 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 		 418 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.59 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.4 
 
 		 419 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 		 423 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.67 
 
 		 434 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.59 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.07 
 
 		 418 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.46 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.46 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.49 
 
 		 418 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.32 
 
 		 418 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.22 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.87 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 423 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.8 
 
 		 419 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.99 
 
 		 419 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>