More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0624 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  97.87 
 
 
423 aa  813    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  97.64 
 
 
435 aa  805    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  89.6 
 
 
423 aa  768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  90.54 
 
 
423 aa  767    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
423 aa  848    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  90.31 
 
 
423 aa  765    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  97.87 
 
 
423 aa  834    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  90.54 
 
 
423 aa  745    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  90.54 
 
 
458 aa  767    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.12 
 
 
426 aa  646    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  93.62 
 
 
423 aa  748    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  99.05 
 
 
423 aa  841    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  93.38 
 
 
423 aa  749    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  90.54 
 
 
458 aa  767    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  90.54 
 
 
458 aa  767    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.12 
 
 
426 aa  647    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  98.11 
 
 
423 aa  834    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  99.05 
 
 
435 aa  841    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  90.54 
 
 
458 aa  767    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  90.54 
 
 
458 aa  767    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.01 
 
 
426 aa  633  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  76.78 
 
 
426 aa  629  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.12 
 
 
426 aa  627  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.81 
 
 
429 aa  591  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.43 
 
 
421 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.51 
 
 
418 aa  565  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.35 
 
 
418 aa  561  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.77 
 
 
434 aa  555  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0257  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.86 
 
 
425 aa  552  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.33 
 
 
421 aa  552  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.01 
 
 
427 aa  549  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.88 
 
 
418 aa  546  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.35 
 
 
420 aa  543  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.4 
 
 
426 aa  537  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  66.11 
 
 
428 aa  537  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.35 
 
 
421 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.35 
 
 
421 aa  534  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.19 
 
 
430 aa  528  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.71 
 
 
432 aa  529  1e-149  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.27 
 
 
421 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.36 
 
 
435 aa  522  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.56 
 
 
419 aa  523  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4584  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.71 
 
 
436 aa  524  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.55 
 
 
421 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0963  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.9 
 
 
437 aa  518  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0723541  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.88 
 
 
429 aa  520  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.63 
 
 
421 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.66 
 
 
425 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3751  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.03 
 
 
430 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4545  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.1 
 
 
426 aa  513  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.09 
 
 
444 aa  513  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.59 
 
 
437 aa  513  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.53 
 
 
425 aa  514  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.03 
 
 
423 aa  508  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0322  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.71 
 
 
433 aa  509  1e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930114  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3262  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.37 
 
 
426 aa  509  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.8 
 
 
419 aa  508  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3913  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.61 
 
 
426 aa  510  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.31 
 
 
423 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0293  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.71 
 
 
433 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00187024  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.35 
 
 
423 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.59 
 
 
423 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6000  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.61 
 
 
426 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0137203 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0269  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.23 
 
 
429 aa  499  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303722  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.11 
 
 
423 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4007  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.51 
 
 
439 aa  493  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000305093 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.52 
 
 
424 aa  482  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  53.83 
 
 
423 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.4 
 
 
418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.4 
 
 
418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.48 
 
 
418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.01 
 
 
418 aa  436  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.51 
 
 
416 aa  438  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.59 
 
 
418 aa  427  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.47 
 
 
418 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.71 
 
 
418 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.3 
 
 
418 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.87 
 
 
418 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.94 
 
 
418 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.29 
 
 
418 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.47 
 
 
418 aa  416  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.54 
 
 
446 aa  414  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.29 
 
 
456 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.86 
 
 
419 aa  408  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.49 
 
 
417 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.1 
 
 
418 aa  408  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.56 
 
 
420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.86 
 
 
418 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.09 
 
 
417 aa  402  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  54.39 
 
 
427 aa  401  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.8 
 
 
417 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.83 
 
 
427 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.87 
 
 
418 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.49 
 
 
415 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.59 
 
 
421 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.84 
 
 
415 aa  401  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3876  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.94 
 
 
427 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0207983 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3011  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.18 
 
 
427 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61903  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
419 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4200  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.94 
 
 
427 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672348  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>