More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0963 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3262  gamma-glutamyl phosphate reductase  81.88 
 
 
426 aa  689    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960329  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3751  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.88 
 
 
430 aa  644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4545  gamma-glutamyl phosphate reductase  80.24 
 
 
426 aa  681    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.44 
 
 
444 aa  661    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4584  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.35 
 
 
436 aa  655    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0963  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
437 aa  890    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0723541  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6000  gamma-glutamyl phosphate reductase  80.94 
 
 
426 aa  667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0137203 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3913  gamma-glutamyl phosphate reductase  82.12 
 
 
426 aa  690    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  71.63 
 
 
437 aa  627  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0269  gamma-glutamyl phosphate reductase  71.95 
 
 
429 aa  568  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303722  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4007  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.13 
 
 
439 aa  566  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000305093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.24 
 
 
426 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.24 
 
 
426 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.9 
 
 
423 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.43 
 
 
423 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.91 
 
 
435 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.24 
 
 
426 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.48 
 
 
423 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.76 
 
 
458 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.76 
 
 
458 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.43 
 
 
423 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.43 
 
 
423 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.76 
 
 
458 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.76 
 
 
458 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.19 
 
 
423 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.43 
 
 
435 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.76 
 
 
458 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.72 
 
 
423 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.29 
 
 
426 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.38 
 
 
423 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.72 
 
 
423 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.41 
 
 
426 aa  500  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.82 
 
 
426 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.63 
 
 
425 aa  494  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.99 
 
 
418 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  59.57 
 
 
428 aa  492  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.43 
 
 
421 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.54 
 
 
429 aa  491  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.87 
 
 
421 aa  490  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.72 
 
 
423 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.72 
 
 
423 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  61 
 
 
421 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.11 
 
 
427 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.57 
 
 
419 aa  482  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.17 
 
 
421 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.72 
 
 
418 aa  480  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.06 
 
 
418 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.11 
 
 
434 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.9 
 
 
421 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0257  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.62 
 
 
425 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.98 
 
 
421 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.98 
 
 
421 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.18 
 
 
429 aa  471  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.58 
 
 
430 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.46 
 
 
432 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0293  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.01 
 
 
433 aa  463  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00187024  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.45 
 
 
435 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0322  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.78 
 
 
433 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930114  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.71 
 
 
419 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.74 
 
 
423 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.98 
 
 
423 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.74 
 
 
423 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.11 
 
 
420 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.74 
 
 
423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.44 
 
 
424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.48 
 
 
425 aa  449  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.02 
 
 
423 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.08 
 
 
418 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.08 
 
 
418 aa  437  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.46 
 
 
417 aa  415  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.91 
 
 
423 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.98 
 
 
418 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.93 
 
 
456 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.16 
 
 
418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.21 
 
 
418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  51 
 
 
417 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
418 aa  395  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.34 
 
 
424 aa  393  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.97 
 
 
418 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.39 
 
 
425 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.34 
 
 
424 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.46 
 
 
416 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.57 
 
 
416 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.94 
 
 
418 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.4 
 
 
419 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.82 
 
 
419 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.55 
 
 
418 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.04 
 
 
415 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.1 
 
 
418 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2337  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.51 
 
 
429 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247409  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.89 
 
 
446 aa  375  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  45 
 
 
418 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.23 
 
 
424 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.34 
 
 
418 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.65 
 
 
415 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.86 
 
 
420 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.26 
 
 
427 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0528  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.76 
 
 
429 aa  366  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.28 
 
 
414 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1215  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.55 
 
 
419 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.235553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>