More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4007 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.04 
 
 		 437 aa  635    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0269  gamma-glutamyl phosphate reductase  81.3 
 
 		 429 aa  646    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303722  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4007  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 439 aa  885    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000305093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0963  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.13 
 
 		 437 aa  615  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0723541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4584  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.16 
 
 		 436 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3262  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.88 
 
 		 426 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3913  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.88 
 
 		 426 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3751  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.26 
 
 		 430 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4545  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.41 
 
 		 426 aa  595  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.64 
 
 		 444 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6000  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.71 
 
 		 426 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.76 
 
 		 426 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.29 
 
 		 426 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.33 
 
 		 435 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.29 
 
 		 426 aa  525  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.8 
 
 		 423 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.59 
 
 		 426 aa  524  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.32 
 
 		 423 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.06 
 
 		 426 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.51 
 
 		 423 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.56 
 
 		 423 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.83 
 
 		 418 aa  521  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.27 
 
 		 423 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.56 
 
 		 458 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.32 
 
 		 423 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.56 
 
 		 458 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.56 
 
 		 458 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.03 
 
 		 423 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.23 
 
 		 434 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.56 
 
 		 423 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.56 
 
 		 458 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.74 
 
 		 435 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.21 
 
 		 425 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.56 
 
 		 458 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.56 
 
 		 423 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.1 
 
 		 421 aa  508  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.82 
 
 		 426 aa  510  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.24 
 
 		 421 aa  511  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.94 
 
 		 421 aa  508  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  62 
 
 		 428 aa  509  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.14 
 
 		 418 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.8 
 
 		 423 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.15 
 
 		 421 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.92 
 
 		 421 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.33 
 
 		 429 aa  497  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.56 
 
 		 423 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.9 
 
 		 429 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.61 
 
 		 432 aa  489  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0257  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.33 
 
 		 425 aa  489  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.42 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.53 
 
 		 418 aa  482  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.62 
 
 		 427 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.82 
 
 		 421 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.82 
 
 		 421 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.58 
 
 		 418 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.25 
 
 		 435 aa  477  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.9 
 
 		 420 aa  476  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.58 
 
 		 418 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.53 
 
 		 419 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.38 
 
 		 430 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0293  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.61 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00187024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0322  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.15 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930114  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.59 
 
 		 423 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.44 
 
 		 425 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.82 
 
 		 423 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.59 
 
 		 423 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.65 
 
 		 423 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.06 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.82 
 
 		 424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 418 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  52.78 
 
 		 423 aa  435  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.18 
 
 		 418 aa  428  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.22 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.31 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.91 
 
 		 417 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.47 
 
 		 446 aa  421  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.1 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.64 
 
 		 418 aa  409  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.24 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.78 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.1 
 
 		 418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.5 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 		 416 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 		 418 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.81 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.1 
 
 		 418 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.07 
 
 		 425 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 		 419 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.63 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.83 
 
 		 424 aa  393  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.51 
 
 		 418 aa  395  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.76 
 
 		 415 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1056  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.59 
 
 		 427 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.92 
 
 		 418 aa  391  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.65 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.41 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.71 
 
 		 420 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.5 
 
 		 416 aa  387  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.61 
 
 		 415 aa  385  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>