More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0293 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0293  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 433 aa  884    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00187024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  84.78 
 
 		 432 aa  747    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0322  gamma-glutamyl phosphate reductase  97 
 
 		 433 aa  839    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.41 
 
 		 418 aa  569  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.03 
 
 		 435 aa  553  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.61 
 
 		 421 aa  541  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.12 
 
 		 420 aa  533  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.41 
 
 		 425 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  60.65 
 
 		 428 aa  525  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.06 
 
 		 418 aa  524  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.47 
 
 		 423 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.05 
 
 		 427 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.56 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.71 
 
 		 418 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.21 
 
 		 435 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.31 
 
 		 434 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.06 
 
 		 423 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.55 
 
 		 421 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.94 
 
 		 423 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.94 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.97 
 
 		 426 aa  508  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.31 
 
 		 421 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.15 
 
 		 426 aa  508  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.71 
 
 		 423 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.12 
 
 		 421 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.28 
 
 		 435 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.72 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.76 
 
 		 423 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  60 
 
 		 423 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.76 
 
 		 429 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.72 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.74 
 
 		 426 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.47 
 
 		 423 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.72 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.72 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.72 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.76 
 
 		 421 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.3 
 
 		 421 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.91 
 
 		 426 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.78 
 
 		 423 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.47 
 
 		 423 aa  498  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.58 
 
 		 426 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.44 
 
 		 426 aa  495  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.48 
 
 		 421 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.38 
 
 		 423 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  60 
 
 		 423 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.48 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.14 
 
 		 423 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.14 
 
 		 423 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.38 
 
 		 423 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.28 
 
 		 419 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.76 
 
 		 423 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.9 
 
 		 430 aa  477  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.62 
 
 		 425 aa  474  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0963  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.01 
 
 		 437 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0723541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3751  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.36 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.41 
 
 		 437 aa  468  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.78 
 
 		 444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0257  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.13 
 
 		 425 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4584  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.23 
 
 		 436 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.97 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3262  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.61 
 
 		 426 aa  462  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3913  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.61 
 
 		 426 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6000  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.31 
 
 		 426 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.74 
 
 		 423 aa  458  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4545  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.72 
 
 		 426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.94 
 
 		 418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.94 
 
 		 418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0269  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.98 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303722  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4007  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.61 
 
 		 439 aa  448  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000305093 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 418 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.51 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.57 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.22 
 
 		 420 aa  404  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.41 
 
 		 418 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.01 
 
 		 446 aa  402  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.32 
 
 		 419 aa  403  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.6 
 
 		 415 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.84 
 
 		 415 aa  398  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.99 
 
 		 418 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.71 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.04 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.1 
 
 		 418 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.35 
 
 		 419 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.46 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.71 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.12 
 
 		 418 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.68 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.86 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1056  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.7 
 
 		 427 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.26 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.3 
 
 		 416 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.36 
 
 		 415 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  46 
 
 		 425 aa  386  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.03 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.96 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.14 
 
 		 422 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1205  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.89 
 
 		 434 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.07 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.257421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>