More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1071 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  94.81 
 
 		 424 aa  827    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  92.22 
 
 		 424 aa  810    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 425 aa  867    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.87 
 
 		 446 aa  449  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.56 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.35 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0763  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.3 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208576 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.98 
 
 		 414 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 416 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.48 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 416 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 416 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.56 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 415 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.66 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.45 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3208  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.52 
 
 		 420 aa  431  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 416 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3350  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.66 
 
 		 422 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000409724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4447  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.14 
 
 		 423 aa  428  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.52 
 
 		 417 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.08 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.04 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.83 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  49.04 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.86 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.85 
 
 		 415 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 		 415 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.74 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.85 
 
 		 418 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2952  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 		 415 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.434526  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.85 
 
 		 416 aa  416  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0968  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.6 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.68 
 
 		 434 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3338  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.02 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2847  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.27 
 
 		 429 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.948477  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.24 
 
 		 415 aa  414  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.69 
 
 		 424 aa  411  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0715531 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 		 425 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.76 
 
 		 424 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.14 
 
 		 418 aa  411  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0240  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0901  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.08 
 
 		 417 aa  408  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0270  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 		 417 aa  411  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0297  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 		 417 aa  411  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952781 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2975  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.11 
 
 		 422 aa  408  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0275  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 		 417 aa  411  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0870327  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.62 
 
 		 415 aa  409  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.4 
 
 		 418 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  47 
 
 		 415 aa  410  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0674  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.48 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0936  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.2 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.91 
 
 		 421 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.39 
 
 		 418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0967  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.41 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.18 
 
 		 426 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.2 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.62 
 
 		 418 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.03 
 
 		 415 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2141  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 459 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000141215 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.66 
 
 		 429 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.2 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.47 
 
 		 421 aa  403  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 417 aa  402  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.41 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.72 
 
 		 420 aa  401  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.51 
 
 		 445 aa  405  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.16 
 
 		 418 aa  403  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3149  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.88 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485003  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.92 
 
 		 420 aa  399  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004267  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.65 
 
 		 411 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000573407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1038  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.11 
 
 		 425 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.901559  hitchhiker  0.0000854394 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.03 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3323  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.11 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3283  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.68 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.2 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3287  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.88 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0441  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 		 423 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 		 425 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0991  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 		 425 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.145269  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2387  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0346385  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.16 
 
 		 416 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.58 
 
 		 418 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.35 
 
 		 421 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3300  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.63 
 
 		 419 aa  398  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00136137  normal  0.0296518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3430  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.68 
 
 		 417 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000815894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3084  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.54 
 
 		 421 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.2 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.03 
 
 		 416 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.61 
 
 		 421 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 		 417 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.6 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0955  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 425 aa  398  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.11 
 
 		 425 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.739308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>