More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2970 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  86.85 
 
 		 426 aa  743    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.25 
 
 		 423 aa  666    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.25 
 
 		 423 aa  660    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  93.19 
 
 		 426 aa  785    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.01 
 
 		 423 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.25 
 
 		 423 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  76.78 
 
 		 423 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.25 
 
 		 458 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.14 
 
 		 429 aa  638    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.25 
 
 		 423 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.25 
 
 		 423 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  87.09 
 
 		 426 aa  762    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 426 aa  862    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  76.07 
 
 		 423 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.25 
 
 		 423 aa  647    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.25 
 
 		 458 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.49 
 
 		 435 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.01 
 
 		 423 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.25 
 
 		 458 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  76.3 
 
 		 423 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  87.09 
 
 		 426 aa  763    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.25 
 
 		 458 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.25 
 
 		 458 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.25 
 
 		 435 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0257  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.67 
 
 		 425 aa  610  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.47 
 
 		 421 aa  598  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.54 
 
 		 421 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.67 
 
 		 418 aa  558  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  69.72 
 
 		 421 aa  554  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  69.48 
 
 		 421 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.16 
 
 		 426 aa  548  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.88 
 
 		 418 aa  546  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.76 
 
 		 421 aa  546  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.35 
 
 		 427 aa  544  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.86 
 
 		 425 aa  541  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.48 
 
 		 429 aa  544  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  64.69 
 
 		 428 aa  540  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.8 
 
 		 432 aa  538  9.999999999999999e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.03 
 
 		 418 aa  537  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.51 
 
 		 419 aa  538  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.18 
 
 		 420 aa  534  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.51 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.22 
 
 		 434 aa  530  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.59 
 
 		 421 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.88 
 
 		 435 aa  525  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3262  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.8 
 
 		 426 aa  522  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960329  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0269  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.67 
 
 		 429 aa  522  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303722  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3913  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.8 
 
 		 426 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.88 
 
 		 430 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.88 
 
 		 421 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3751  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.53 
 
 		 430 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.24 
 
 		 423 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4584  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.66 
 
 		 436 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4545  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.62 
 
 		 426 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.63 
 
 		 437 aa  514  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0963  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.82 
 
 		 437 aa  512  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0723541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.06 
 
 		 423 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.32 
 
 		 419 aa  508  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.56 
 
 		 444 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.12 
 
 		 423 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6000  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.03 
 
 		 426 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137203 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4007  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.06 
 
 		 439 aa  501  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000305093 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.18 
 
 		 423 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0293  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.44 
 
 		 433 aa  497  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00187024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0322  gamma-glutamyl phosphate reductase  60 
 
 		 433 aa  497  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.18 
 
 		 423 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.03 
 
 		 418 aa  481  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.03 
 
 		 418 aa  481  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.66 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  54.46 
 
 		 423 aa  455  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.04 
 
 		 418 aa  450  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.66 
 
 		 418 aa  443  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.16 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.67 
 
 		 418 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.9 
 
 		 418 aa  422  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 416 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.25 
 
 		 418 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.42 
 
 		 446 aa  413  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 		 418 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.3 
 
 		 456 aa  408  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.2 
 
 		 419 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0413  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.24 
 
 		 431 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399966  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.33 
 
 		 415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.09 
 
 		 415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3876  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0207983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.55 
 
 		 418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.92 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.91 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.17 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4200  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 427 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.23 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.42 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.45 
 
 		 416 aa  400  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.91 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.76 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.5 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.76 
 
 		 414 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.28 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>