More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3876 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  80.09 
 
 
427 aa  689    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4200  gamma-glutamyl phosphate reductase  95.32 
 
 
427 aa  823    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672348  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3876  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
427 aa  860    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0207983 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.18 
 
 
427 aa  636    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.76 
 
 
421 aa  632  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3011  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.41 
 
 
427 aa  626  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61903  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1056  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.88 
 
 
427 aa  618  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3456  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.01 
 
 
428 aa  579  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0159  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.14 
 
 
430 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.55 
 
 
424 aa  545  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0444  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.11 
 
 
430 aa  543  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.312195  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0413  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.2 
 
 
431 aa  530  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399966  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2058  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.51 
 
 
457 aa  525  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.498177  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0571  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.43 
 
 
430 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154303  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0253  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.71 
 
 
430 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0419  gamma-glutamyl phosphate reductase  65 
 
 
429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.602103 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.92 
 
 
432 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.836596  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0520  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.08 
 
 
430 aa  513  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121097  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2868  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.87 
 
 
432 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3094  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.61 
 
 
432 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0319  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.02 
 
 
412 aa  505  9.999999999999999e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0103  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.43 
 
 
432 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.994876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0161  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.74 
 
 
433 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.310719  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3276  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.32 
 
 
429 aa  497  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4218  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.16 
 
 
431 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4728  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.92 
 
 
431 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  60.05 
 
 
427 aa  480  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1205  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.9 
 
 
434 aa  480  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906514  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3804  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.96 
 
 
420 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.81 
 
 
422 aa  472  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1469  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.15 
 
 
421 aa  466  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300791  normal  0.0287865 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3824  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.47 
 
 
420 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3516  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.47 
 
 
420 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1084  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.83 
 
 
426 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0060  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.52 
 
 
425 aa  448  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0581  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.43 
 
 
429 aa  450  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.154304  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4503  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.19 
 
 
423 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4717  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.55 
 
 
424 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.144444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2669  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.21 
 
 
418 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2337  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.48 
 
 
429 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247409  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.52 
 
 
421 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.19 
 
 
420 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1382  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
415 aa  412  1e-114  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.25 
 
 
414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.42 
 
 
423 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.65 
 
 
423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.47 
 
 
458 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.71 
 
 
423 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.47 
 
 
458 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.47 
 
 
458 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.47 
 
 
458 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.47 
 
 
458 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.32 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.47 
 
 
423 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.06 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 
418 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 
423 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
423 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.65 
 
 
423 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
423 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.65 
 
 
435 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.65 
 
 
435 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
427 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.02 
 
 
419 aa  395  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.92 
 
 
423 aa  396  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.25 
 
 
415 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1548  gamma-glutamyl phosphate reductase  56 
 
 
420 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.751317  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.42 
 
 
418 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
430 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.53 
 
 
426 aa  388  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.94 
 
 
426 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.57 
 
 
418 aa  388  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.26 
 
 
418 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.58 
 
 
426 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
423 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.68 
 
 
418 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
426 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.82 
 
 
426 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 
421 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 
426 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.81 
 
 
419 aa  385  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.43 
 
 
418 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.85 
 
 
418 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.32 
 
 
415 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.54 
 
 
415 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.3 
 
 
415 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.54 
 
 
415 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 
423 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.99 
 
 
432 aa  382  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.41 
 
 
423 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.84 
 
 
418 aa  382  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.79 
 
 
421 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.09 
 
 
418 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.73 
 
 
434 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.78 
 
 
415 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 
419 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.09 
 
 
418 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.8 
 
 
419 aa  380  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.06 
 
 
415 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>