More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3011 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.64 
 
 		 427 aa  657    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3876  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.41 
 
 		 427 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0207983 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3011  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 427 aa  849    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4200  gamma-glutamyl phosphate reductase  74 
 
 		 427 aa  631  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.3 
 
 		 427 aa  620  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.38 
 
 		 421 aa  617  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1056  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.77 
 
 		 427 aa  613  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3456  gamma-glutamyl phosphate reductase  71.5 
 
 		 428 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0444  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.88 
 
 		 430 aa  550  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.312195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0319  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.61 
 
 		 412 aa  532  1e-150  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.59 
 
 		 424 aa  530  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0159  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.14 
 
 		 430 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2058  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.25 
 
 		 457 aa  514  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.498177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.24 
 
 		 422 aa  508  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0520  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.16 
 
 		 430 aa  504  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121097  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1205  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.86 
 
 		 434 aa  506  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0419  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.91 
 
 		 429 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.602103 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0413  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.81 
 
 		 431 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399966  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0161  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.58 
 
 		 433 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.310719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3094  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.52 
 
 		 432 aa  498  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3804  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.13 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0571  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.11 
 
 		 430 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2868  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.52 
 
 		 432 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3276  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.79 
 
 		 429 aa  497  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.05 
 
 		 432 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.836596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0253  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.38 
 
 		 430 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  61.1 
 
 		 427 aa  490  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1469  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.59 
 
 		 421 aa  491  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300791  normal  0.0287865 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3516  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.81 
 
 		 420 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3824  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.81 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4728  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.53 
 
 		 431 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0103  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.89 
 
 		 432 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.994876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4218  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.77 
 
 		 431 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0581  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.8 
 
 		 429 aa  472  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.154304  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4503  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.16 
 
 		 423 aa  461  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0060  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.05 
 
 		 425 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4717  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.38 
 
 		 424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.144444 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2669  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.52 
 
 		 418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1084  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.33 
 
 		 426 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2337  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.11 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247409  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.32 
 
 		 421 aa  427  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 418 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.42 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.66 
 
 		 423 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.76 
 
 		 418 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.66 
 
 		 458 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.66 
 
 		 458 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.31 
 
 		 427 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1382  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.28 
 
 		 415 aa  414  1e-114  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.66 
 
 		 458 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.66 
 
 		 458 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.77 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.66 
 
 		 458 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.08 
 
 		 418 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.42 
 
 		 423 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 		 418 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.2 
 
 		 420 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.77 
 
 		 423 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.06 
 
 		 435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.57 
 
 		 421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.3 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.25 
 
 		 418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.54 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 		 419 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.54 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.08 
 
 		 421 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.47 
 
 		 426 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.65 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.44 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.47 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.66 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.83 
 
 		 415 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.32 
 
 		 415 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.47 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3028  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.57 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00693675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.08 
 
 		 415 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.29 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.43 
 
 		 418 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.06 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.08 
 
 		 415 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1548  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.89 
 
 		 420 aa  396  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.751317  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.95 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.12 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.83 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.2 
 
 		 423 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.44 
 
 		 429 aa  393  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.71 
 
 		 423 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.59 
 
 		 415 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.18 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.42 
 
 		 425 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.6 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.15 
 
 		 419 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.92 
 
 		 418 aa  390  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2781  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.08 
 
 		 414 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2993  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.81 
 
 		 415 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2252  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.08 
 
 		 415 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.628785  normal  0.156933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>