More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4200 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3876  gamma-glutamyl phosphate reductase  95.32 
 
 
427 aa  823    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0207983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4200  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
427 aa  858    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672348  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  79.86 
 
 
427 aa  684    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.42 
 
 
421 aa  629  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.65 
 
 
427 aa  630  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3011  gamma-glutamyl phosphate reductase  74 
 
 
427 aa  621  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61903  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1056  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.41 
 
 
427 aa  607  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3456  gamma-glutamyl phosphate reductase  71.5 
 
 
428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0444  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.35 
 
 
430 aa  546  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.312195  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0159  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.26 
 
 
430 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.35 
 
 
424 aa  538  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0413  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.4 
 
 
431 aa  531  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399966  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2058  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.55 
 
 
457 aa  519  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.498177  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.32 
 
 
432 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.836596  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0571  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.52 
 
 
430 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154303  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0520  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.85 
 
 
430 aa  511  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121097  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0253  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.38 
 
 
430 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3094  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.47 
 
 
432 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0419  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.91 
 
 
429 aa  505  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.602103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2868  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.7 
 
 
432 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0319  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.77 
 
 
412 aa  502  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3276  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.32 
 
 
429 aa  498  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295726 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0103  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.17 
 
 
432 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.994876 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0161  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.97 
 
 
433 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.310719  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4218  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.64 
 
 
431 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4728  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.97 
 
 
431 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3804  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.96 
 
 
420 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  60.29 
 
 
427 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1205  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.57 
 
 
434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906514  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.47 
 
 
422 aa  467  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1469  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.63 
 
 
421 aa  466  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300791  normal  0.0287865 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3824  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.19 
 
 
420 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3516  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.19 
 
 
420 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4503  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.95 
 
 
423 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1084  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.58 
 
 
426 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0060  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.8 
 
 
425 aa  442  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0581  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.77 
 
 
429 aa  437  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.154304  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2669  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.1 
 
 
418 aa  435  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4717  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.38 
 
 
424 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.144444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2337  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.56 
 
 
429 aa  425  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247409  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.76 
 
 
421 aa  424  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1382  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 
415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.84 
 
 
420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.06 
 
 
423 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.89 
 
 
423 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
423 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.71 
 
 
423 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.25 
 
 
414 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
423 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.8 
 
 
418 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.06 
 
 
418 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.65 
 
 
435 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
423 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 
423 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.08 
 
 
418 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.84 
 
 
427 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.29 
 
 
426 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 
418 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.65 
 
 
423 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1548  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.53 
 
 
420 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.751317  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.65 
 
 
435 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.44 
 
 
423 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 
426 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.3 
 
 
418 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.29 
 
 
426 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 
426 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.77 
 
 
419 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.49 
 
 
415 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
423 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.17 
 
 
418 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 
418 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.54 
 
 
415 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.3 
 
 
415 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.26 
 
 
419 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 
426 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.47 
 
 
426 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.65 
 
 
423 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.54 
 
 
415 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.54 
 
 
415 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.51 
 
 
415 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.32 
 
 
418 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.35 
 
 
418 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.51 
 
 
430 aa  381  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.03 
 
 
421 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.09 
 
 
418 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
423 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.57 
 
 
418 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.68 
 
 
418 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.6 
 
 
418 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3028  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.54 
 
 
415 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00693675  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.6 
 
 
432 aa  375  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.82 
 
 
418 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.07 
 
 
415 aa  375  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.45 
 
 
418 aa  377  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2781  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.54 
 
 
414 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>