More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3778 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  77.75 
 
 		 418 aa  663    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 418 aa  854    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  78.9 
 
 		 418 aa  677    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  98.56 
 
 		 418 aa  845    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.78 
 
 		 418 aa  655    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  80.38 
 
 		 418 aa  712    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.62 
 
 		 418 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  69.54 
 
 		 418 aa  598  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.95 
 
 		 418 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.11 
 
 		 416 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.31 
 
 		 418 aa  481  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.93 
 
 		 414 aa  479  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  53 
 
 		 418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.47 
 
 		 423 aa  460  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.05 
 
 		 419 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.72 
 
 		 414 aa  457  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.58 
 
 		 419 aa  456  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.16 
 
 		 419 aa  456  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.42 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 		 418 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  55 
 
 		 416 aa  448  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.24 
 
 		 418 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.57 
 
 		 430 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.1 
 
 		 415 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.1 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.67 
 
 		 418 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.55 
 
 		 421 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.84 
 
 		 456 aa  435  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0321  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.37 
 
 		 435 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155357  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.36 
 
 		 415 aa  435  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.08 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.31 
 
 		 411 aa  435  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.82 
 
 		 446 aa  435  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.8 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 		 415 aa  433  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.09 
 
 		 420 aa  431  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.72 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0431  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.32 
 
 		 448 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4145  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.21 
 
 		 413 aa  428  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0291  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.48 
 
 		 425 aa  429  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000393853  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.6 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0441  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.13 
 
 		 423 aa  428  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.08 
 
 		 416 aa  426  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3942  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.85 
 
 		 415 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.08 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4057  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.85 
 
 		 415 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3849  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.61 
 
 		 415 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  53.01 
 
 		 423 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.56 
 
 		 421 aa  419  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0081  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.67 
 
 		 415 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0151  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.54 
 
 		 417 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0762  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.44 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.34 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1215  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.58 
 
 		 419 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.8 
 
 		 418 aa  411  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.1 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.44 
 
 		 420 aa  411  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2873  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.14 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 418 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.45 
 
 		 425 aa  410  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 418 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.53 
 
 		 421 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0674  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.93 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.92 
 
 		 418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 		 418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.63 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.81 
 
 		 432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1633  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 		 419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4238  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 		 415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4425  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 		 415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.99 
 
 		 421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.16 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1645  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 		 431 aa  407  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  hitchhiker  0.00108459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2672  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 424 aa  401  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3015  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.66 
 
 		 415 aa  403  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.91 
 
 		 413 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.6 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.87 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.1 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0115  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.28 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.87 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.32 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4285  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.7 
 
 		 415 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.04 
 
 		 421 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.04 
 
 		 415 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.39 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.63 
 
 		 427 aa  398  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.7 
 
 		 415 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.61 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.6 
 
 		 421 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.33 
 
 		 415 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>