More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3456 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3456  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
428 aa  853    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.78 
 
 
421 aa  629  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.41 
 
 
427 aa  630  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1056  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.88 
 
 
427 aa  618  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.5 
 
 
427 aa  609  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3876  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.01 
 
 
427 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0207983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4200  gamma-glutamyl phosphate reductase  71.5 
 
 
427 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672348  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3011  gamma-glutamyl phosphate reductase  71.5 
 
 
427 aa  594  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61903  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.83 
 
 
424 aa  547  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0159  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.03 
 
 
430 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0413  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.82 
 
 
431 aa  525  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399966  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0444  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.64 
 
 
430 aa  524  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.312195  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0319  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.71 
 
 
412 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2868  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.31 
 
 
432 aa  511  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3094  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.31 
 
 
432 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2058  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.03 
 
 
457 aa  513  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.498177  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.39 
 
 
432 aa  511  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.836596  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3276  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.27 
 
 
429 aa  501  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295726 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0161  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.24 
 
 
433 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.310719  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0103  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.96 
 
 
432 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.994876 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  62.95 
 
 
427 aa  494  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0253  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.31 
 
 
430 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0419  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.8 
 
 
429 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.602103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0571  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.11 
 
 
430 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154303  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.15 
 
 
422 aa  488  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0520  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.16 
 
 
430 aa  487  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4728  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.64 
 
 
431 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1205  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.57 
 
 
434 aa  474  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906514  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4218  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.95 
 
 
431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3804  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.53 
 
 
420 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3824  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.83 
 
 
420 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1469  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.67 
 
 
421 aa  464  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300791  normal  0.0287865 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0581  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.63 
 
 
429 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.154304  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3516  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.83 
 
 
420 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4503  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.88 
 
 
423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2337  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.02 
 
 
429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247409  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2669  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.91 
 
 
418 aa  444  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1084  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.08 
 
 
426 aa  439  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0060  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.73 
 
 
425 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.76 
 
 
418 aa  425  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.72 
 
 
420 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4717  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.14 
 
 
424 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.144444 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.5 
 
 
414 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.32 
 
 
421 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.17 
 
 
418 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.18 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.18 
 
 
423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.76 
 
 
418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.18 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1382  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.28 
 
 
415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.03 
 
 
418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.18 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.68 
 
 
435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 
418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.18 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.76 
 
 
419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.91 
 
 
427 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.62 
 
 
418 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.18 
 
 
458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.88 
 
 
418 aa  405  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
423 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.75 
 
 
418 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.44 
 
 
418 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.92 
 
 
423 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
423 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.53 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 
418 aa  397  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.48 
 
 
421 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
423 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
429 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.42 
 
 
423 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.68 
 
 
423 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
423 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
435 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.89 
 
 
418 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.18 
 
 
435 aa  398  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.89 
 
 
432 aa  395  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
423 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 
421 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.26 
 
 
417 aa  392  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.4 
 
 
418 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.69 
 
 
419 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
423 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.35 
 
 
423 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.68 
 
 
423 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.22 
 
 
419 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.92 
 
 
423 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0293  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.42 
 
 
433 aa  388  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00187024  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.03 
 
 
418 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.77 
 
 
428 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.29 
 
 
415 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.13 
 
 
418 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.52 
 
 
413 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.6 
 
 
411 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.28 
 
 
419 aa  386  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.04 
 
 
415 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.04 
 
 
415 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0322  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.95 
 
 
433 aa  383  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930114  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.79 
 
 
429 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>