More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1312 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 411 aa  843    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.37 
 
 		 410 aa  556  1e-157  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.07 
 
 		 418 aa  448  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.32 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.9 
 
 		 418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.86 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.31 
 
 		 418 aa  435  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.31 
 
 		 418 aa  435  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.49 
 
 		 418 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.63 
 
 		 414 aa  428  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1319  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 407 aa  429  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0634  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.02 
 
 		 407 aa  429  1e-119  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 		 418 aa  425  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.64 
 
 		 419 aa  419  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.38 
 
 		 418 aa  418  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 418 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.99 
 
 		 419 aa  415  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.5 
 
 		 423 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.41 
 
 		 418 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.56 
 
 		 418 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.49 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.78 
 
 		 420 aa  409  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.02 
 
 		 418 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.36 
 
 		 419 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.54 
 
 		 415 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.29 
 
 		 415 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.27 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0936  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.12 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.28 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3149  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.03 
 
 		 419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.91 
 
 		 420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3287  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.03 
 
 		 419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.07 
 
 		 418 aa  403  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0968  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.7 
 
 		 417 aa  405  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.65 
 
 		 446 aa  403  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0762  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.15 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 456 aa  405  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3300  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.79 
 
 		 419 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00136137  normal  0.0296518 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2873  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.78 
 
 		 413 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0151  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.57 
 
 		 420 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2672  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.35 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.89 
 
 		 415 aa  395  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.38 
 
 		 415 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.8 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0901  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.1 
 
 		 417 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.93 
 
 		 419 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.16 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3942  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.87 
 
 		 415 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4057  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.87 
 
 		 415 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.45 
 
 		 427 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.55 
 
 		 416 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3084  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.1 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.32 
 
 		 417 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.23 
 
 		 421 aa  395  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.76 
 
 		 416 aa  393  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.94 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.02 
 
 		 424 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1268  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.01 
 
 		 409 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.3 
 
 		 416 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.08 
 
 		 417 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.08 
 
 		 417 aa  388  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.64 
 
 		 421 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  46.08 
 
 		 417 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.32 
 
 		 421 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3338  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.08 
 
 		 417 aa  388  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.22 
 
 		 418 aa  389  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0081  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.36 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.94 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.4 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.55 
 
 		 416 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 		 414 aa  391  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.28 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2847  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.8 
 
 		 429 aa  388  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.948477  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.7 
 
 		 413 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.3 
 
 		 416 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3849  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.12 
 
 		 415 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.4 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0275  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.83 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0870327  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1122  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.07 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.13 
 
 		 421 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.45 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0240  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.08 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0408  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.1 
 
 		 418 aa  388  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.14 
 
 		 415 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0270  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.83 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.74 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.55 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.55 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0297  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.08 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952781 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.81 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.28 
 
 		 415 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.19 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0715531 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.36 
 
 		 418 aa  385  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.74 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.33 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.83 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0967  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.12 
 
 		 424 aa  381  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0083  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.46 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.77 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.36 
 
 		 418 aa  385  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>