More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1205 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1205  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 434 aa  874    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2285  gamma-glutamyl phosphate reductase  71.97 
 
 		 422 aa  604  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.207157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1469  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.87 
 
 		 421 aa  579  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300791  normal  0.0287865 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3804  gamma-glutamyl phosphate reductase  69.14 
 
 		 420 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.258321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3516  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.97 
 
 		 420 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3824  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.66 
 
 		 420 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3011  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.86 
 
 		 427 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61903  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.53 
 
 		 421 aa  486  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.53 
 
 		 427 aa  488  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4503  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.17 
 
 		 423 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3876  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.9 
 
 		 427 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0207983 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.62 
 
 		 427 aa  475  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  60.19 
 
 		 427 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4200  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.57 
 
 		 427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1056  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.29 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3456  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.57 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1478  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.67 
 
 		 424 aa  448  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0444  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.12 
 
 		 430 aa  448  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.312195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0413  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.64 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399966  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0319  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.83 
 
 		 412 aa  435  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0419  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.55 
 
 		 429 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.602103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0159  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.25 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0571  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.73 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0520  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.59 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121097  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0581  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.96 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.154304  normal  0.722441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0253  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.63 
 
 		 430 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.57 
 
 		 418 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 421 aa  415  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.63 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2058  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.89 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.498177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2669  gamma-glutamyl phosphate reductase  53 
 
 		 418 aa  412  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1084  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.19 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.73 
 
 		 418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.44 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.29 
 
 		 435 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.71 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2868  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.3 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3094  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.07 
 
 		 432 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3028  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.68 
 
 		 415 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00693675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.19 
 
 		 415 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.96 
 
 		 421 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.19 
 
 		 415 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.19 
 
 		 415 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 		 418 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0161  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.1 
 
 		 433 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.310719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.44 
 
 		 415 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2337  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.69 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247409  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0103  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.13 
 
 		 432 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.994876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.08 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.836596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 429 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.19 
 
 		 428 aa  396  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.92 
 
 		 423 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2781  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.44 
 
 		 414 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1382  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 		 415 aa  393  1e-108  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3276  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.59 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00295726 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2992  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.44 
 
 		 414 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.440021  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.21 
 
 		 418 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0060  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.16 
 
 		 425 aa  395  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.21 
 
 		 418 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.68 
 
 		 423 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.18 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.44 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.96 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.92 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.19 
 
 		 418 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.21 
 
 		 418 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.03 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  48 
 
 		 416 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2873  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.54 
 
 		 413 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.44 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.44 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.58 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.46 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.19 
 
 		 418 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 		 425 aa  381  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4717  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.07 
 
 		 424 aa  378  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.144444 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.46 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4728  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.42 
 
 		 431 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.84 
 
 		 418 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.05 
 
 		 429 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2993  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.45 
 
 		 415 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2252  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.36 
 
 		 415 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.628785  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0322  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.84 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.67 
 
 		 419 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 		 435 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>