More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0953 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
446 aa  912    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0674  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.68 
 
 
441 aa  583  1.0000000000000001e-165  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.57 
 
 
418 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.07 
 
 
418 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  53.73 
 
 
419 aa  463  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.22 
 
 
418 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.32 
 
 
416 aa  456  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.35 
 
 
424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.64 
 
 
418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.61 
 
 
418 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.87 
 
 
425 aa  449  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.93 
 
 
419 aa  450  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.07 
 
 
424 aa  451  1e-125  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.24 
 
 
418 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.24 
 
 
418 aa  443  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.94 
 
 
414 aa  443  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.25 
 
 
415 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.45 
 
 
418 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.77 
 
 
415 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.29 
 
 
418 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.2 
 
 
418 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.35 
 
 
416 aa  436  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 
434 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.82 
 
 
418 aa  435  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.64 
 
 
419 aa  435  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.53 
 
 
418 aa  433  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.04 
 
 
419 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.29 
 
 
415 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.32 
 
 
425 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.65 
 
 
418 aa  425  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.18 
 
 
418 aa  422  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3751  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.46 
 
 
430 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
430 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0441  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.65 
 
 
423 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 
415 aa  420  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.34 
 
 
420 aa  420  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.08 
 
 
415 aa  420  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.24 
 
 
423 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.54 
 
 
423 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.48 
 
 
421 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.29 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
427 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.41 
 
 
418 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.77 
 
 
417 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2730  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.32 
 
 
415 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.53 
 
 
456 aa  413  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.3 
 
 
419 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2988  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.32 
 
 
415 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012162 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2789  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.92 
 
 
415 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.35 
 
 
420 aa  413  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.11 
 
 
423 aa  412  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0083  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.7 
 
 
425 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2711  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.08 
 
 
415 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0725314  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.62 
 
 
421 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.25 
 
 
418 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0269  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.71 
 
 
429 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303722  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.95 
 
 
426 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.47 
 
 
435 aa  409  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.21 
 
 
417 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.47 
 
 
425 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3027  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.84 
 
 
415 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297708  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.54 
 
 
435 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.52 
 
 
415 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.71 
 
 
432 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.9 
 
 
423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3028  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.84 
 
 
415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00693675  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2781  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 
414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.268278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.69 
 
 
413 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.76 
 
 
426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0528  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.59 
 
 
429 aa  408  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2992  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.56 
 
 
414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.440021  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.31 
 
 
423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.14 
 
 
423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.71 
 
 
426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.9 
 
 
423 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.6 
 
 
423 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.14 
 
 
421 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.42 
 
 
418 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1633  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.65 
 
 
419 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565136  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4584  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.61 
 
 
436 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.65 
 
 
411 aa  403  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.42 
 
 
426 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.14 
 
 
423 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.6 
 
 
423 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.31 
 
 
435 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.31 
 
 
423 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.96 
 
 
414 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2884  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.71 
 
 
428 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.75 
 
 
437 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.54 
 
 
423 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.53 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.89 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.54 
 
 
458 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.54 
 
 
458 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.9 
 
 
421 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.26 
 
 
414 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.92 
 
 
445 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.54 
 
 
458 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.54 
 
 
458 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.54 
 
 
458 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>