52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3897 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3897  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 299 aa  577  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2847  cyclic nucleotide-binding protein  52.61 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.516228  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3524  cyclic nucleotide-binding protein  52.17 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1688  cyclic nucleotide-binding protein  43.72 
 
 		 243 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1040  cyclic nucleotide-binding protein  23.15 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.464794 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3233  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0787  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.57 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 224 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0796  cyclic nucleotide-binding protein  22.11 
 
 		 238 aa  50.8  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 224 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1047  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  25.58 
 
 		 247 aa  49.7  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.36 
 
 		 229 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.36 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.23 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0229  cyclic nucleotide-binding protein  30.11 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1425  CRP/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.61 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  29.83 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 		 242 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 254 aa  45.8  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 310 aa  45.8  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.57 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.42 
 
 		 226 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.06 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4212  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  24.39 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1207  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  26.4 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  26.26 
 
 		 225 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0917  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.73 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  25 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1622  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.366469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.37 
 
 		 228 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0035  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2132  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.84 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263338  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  29.94 
 
 		 225 aa  43.5  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  23.6 
 
 		 230 aa  43.5  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 225 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2120  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 245 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.16 
 
 		 230 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0267635  normal  0.395563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.42 
 
 		 228 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.1 
 
 		 226 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  29 
 
 		 228 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 		 225 aa  42.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.47 
 
 		 227 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2531  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  20.59 
 
 		 226 aa  42.7  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1377  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 239 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1540  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 630 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>