212 genes were found for organism Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Caul_5080  CDS  NC_010335  184  1437  +  1254  peptidase S10 serine carboxypeptidase  YP_001676514  unclonable  0.000000000112364  normal  0.0461552  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5081  CDS  NC_010335  1415  2725  +  1311  peptidase S10 serine carboxypeptidase  YP_001676515  decreased coverage  0.00000000372495  normal  0.0461552  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5082  CDS  NC_010335  2722  3930  -  1209  aminotransferase class V  YP_001676516  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5083  CDS  NC_010335  3942  4415  -  474  endoribonuclease L-PSP  YP_001676517  hitchhiker  0.000803015  normal  0.0820919  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5084  CDS  NC_010335  4412  5914  -  1503  peptidase S10 serine carboxypeptidase  YP_001676518  normal  0.110686  normal  0.189262  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5085  CDS  NC_010335  6217  6987  +  771  aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase  YP_001676519  normal  0.193259  normal  0.545985  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5086  CDS  NC_010335  7211  7642  +  432  OsmC family protein  YP_001676520  normal  0.252827  normal  0.822138  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5087  CDS  NC_010335  7657  8247  -  591  TetR family transcriptional regulator  YP_001676521  normal  0.305126  normal  0.842071  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5088  CDS  NC_010335  8339  9496  +  1158  acetyl-CoA acetyltransferase  YP_001676522  normal  0.225671  normal  0.910861  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5089  CDS  NC_010335  9517  10014  +  498  thioesterase superfamily protein  YP_001676523  normal  0.765529  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5090  CDS  NC_010335  10099  10437  -  339  hypothetical protein  YP_001676524  normal  0.760981  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5091  CDS  NC_010335  10603  11076  -  474  hypothetical protein  YP_001676525  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5092  CDS  NC_010335  11205  11960  -  756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001676526  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5093  CDS  NC_010335  12036  13373  -  1338  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  YP_001676527  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5094  CDS  NC_010335  13562  13954  -  393  hypothetical protein  YP_001676528  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5095  CDS  NC_010335  14108  14332  -  225  hypothetical protein  YP_001676529  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5096  CDS  NC_010335  14404  14715  -  312  hypothetical protein  YP_001676530  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5097  CDS  NC_010335  14933  15532  -  600  TetR family transcriptional regulator  YP_001676531  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5098  CDS  NC_010335  15884  17020  +  1137  major facilitator transporter  YP_001676532  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5099  CDS  NC_010335  17052  17435  -  384  hypothetical protein  YP_001676533  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5100  CDS  NC_010335  17483  17857  -  375  hypothetical protein  YP_001676534  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5101  CDS  NC_010335  17905  18285  -  381  HxlR family transcriptional regulator  YP_001676535  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5102  CDS  NC_010335  18369  18980  -  612  TetR family transcriptional regulator  YP_001676536  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5103  CDS  NC_010335  19138  20646  -  1509  RND efflux system outer membrane lipoprotein  YP_001676537  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5104  CDS  NC_010335  20733  21350  +  618  TetR family transcriptional regulator  YP_001676538  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5105  CDS  NC_010335  21425  22471  +  1047  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_001676539  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5106  CDS  NC_010335  22468  25617  +  3150  acriflavin resistance protein  YP_001676540  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5107  CDS  NC_010335  25718  26395  +  678  TetR family transcriptional regulator  YP_001676541  normal  0.346129  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5108  CDS  NC_010335  26403  27353  -  951  AraC family transcriptional regulator  YP_001676542  normal  0.310256  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5109  CDS  NC_010335  27462  27791  -  330  hypothetical protein  YP_001676543  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5110  CDS  NC_010335  28094  28711  +  618  TetR family transcriptional regulator  YP_001676544  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5111  CDS  NC_010335  28708  28986  -  279  hypothetical protein  YP_001676545  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5112  CDS  NC_010335  29128  30246  -  1119  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_001676546  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5113  CDS  NC_010335  30316  31290  -  975  alcohol dehydrogenase  YP_001676547  normal  0.279599  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5114  CDS  NC_010335  31293  31892  -  600  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  YP_001676548  normal  0.581328  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5115  CDS  NC_010335  31916  32929  -  1014  alcohol dehydrogenase  YP_001676549  normal  0.507573  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5116  CDS  NC_010335  33249  33872  +  624  TetR family transcriptional regulator  YP_001676550  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5117  CDS  NC_010335  34000  34746  +  747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001676551  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5118  CDS  NC_010335  34819  36180  +  1362  multi anti extrusion protein MatE  YP_001676552  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5119  CDS  NC_010335  36177  37094  -  918  LysR family transcriptional regulator  YP_001676553  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5120  CDS  NC_010335  37187  38086  -  900  LysR family transcriptional regulator  YP_001676554  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5121  CDS  NC_010335  38595  39785  +  1191  RND family efflux transporter MFP subunit  YP_001676555  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5122  CDS  NC_010335  39812  43030  +  3219  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  YP_001676556  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5123  CDS  NC_010335  43042  44574  +  1533  RND efflux system outer membrane lipoprotein  YP_001676557  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5124  CDS  NC_010335  44571  45551  +  981  luciferase family protein  YP_001676558  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5125  CDS  NC_010335  45596  46513  -  918  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  YP_001676559  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5126  CDS  NC_010335  46675  47133  +  459  HxlR family transcriptional regulator  YP_001676560  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5127  CDS  NC_010335  47198  47623  +  426  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  YP_001676561  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5128  CDS  NC_010335  47680  48795  +  1116  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_001676562  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5129  CDS  NC_010335  48843  49235  +  393  4-oxalocrotonate tautomerase  YP_001676563  normal  0.741439  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5130  CDS  NC_010335  49280  49891  -  612  TetR family transcriptional regulator  YP_001676564  normal  0.943479  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5131  CDS  NC_010335  49897  51105  -  1209  major facilitator transporter  YP_001676565  normal  0.229934  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5132  CDS  NC_010335  51243  52151  -  909  LysR family transcriptional regulator  YP_001676566  normal  0.052958  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5133  CDS  NC_010335  52298  53422  +  1125  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_001676567  normal  0.249326  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5134  CDS  NC_010335  53506  54777  +  1272  epocide hydrolase domain-containing protein  YP_001676568  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5135  CDS  NC_010335  54795  55994  +  1200  major facilitator transporter  YP_001676569  normal  0.774559  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5136  CDS  NC_010335  56313  57077  +  765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001676570  normal  0.708802  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5137  CDS  NC_010335  57415  58128  +  714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001676571  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5138  CDS  NC_010335  58183  58692  +  510  hypothetical protein  YP_001676572  normal  0.4473  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5139  CDS  NC_010335  58741  59643  -  903  LysR family transcriptional regulator  YP_001676573  normal  0.528058  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5140  CDS  NC_010335  59740  60822  +  1083  hypothetical protein  YP_001676574  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5141  CDS  NC_010335  60874  61773  +  900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  YP_001676575  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5142  CDS  NC_010335  61807  63606  +  1800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_001676576  normal  0.367406  normal  0.838811  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5143  CDS  NC_010335  63669  63851  +  183  hypothetical protein  YP_001676577  normal  0.297074  normal  0.700623  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5144  CDS  NC_010335  64004  65206  +  1203  acetyl-CoA acetyltransferase  YP_001676578  normal  0.227388  normal  0.833116  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5145  CDS  NC_010335  65239  66252  +  1014  luciferase family protein  YP_001676579  normal  0.11166  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5146  CDS  NC_010335  66252  66734  +  483  hypothetical protein  YP_001676580  normal  0.317487  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5147  CDS  NC_010335  66768  67409  -  642  metal dependent phosphohydrolase  YP_001676581  normal  0.144948  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5148  CDS  NC_010335  67514  68500  +  987  AraC family transcriptional regulator  YP_001676582  normal  0.0642429  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5149  CDS  NC_010335  68497  68925  -  429  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  YP_001676583  normal  0.20189  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5150  CDS  NC_010335  68932  69546  -  615  TetR family transcriptional regulator  YP_001676584  normal  0.491017  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5151  CDS  NC_010335  69663  69959  -  297  hypothetical protein  YP_001676585  normal  0.593344  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5152  CDS  NC_010335  70019  71227  -  1209  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  YP_001676586  normal  0.506214  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5153  CDS  NC_010335  71251  71982  -  732  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_001676587  normal  0.270613  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5154  CDS  NC_010335  72076  72729  -  654  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_001676588  normal  0.176313  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5155  CDS  NC_010335  72843  73739  +  897  LysR family transcriptional regulator  YP_001676589  normal  0.272154  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5156  CDS  NC_010335  73747  74091  -  345  hypothetical protein  YP_001676590  normal  0.320276  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5157  CDS  NC_010335  74194  74505  +  312  hypothetical protein  YP_001676591  normal  0.426554  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5158  CDS  NC_010335  74502  74945  +  444  hypothetical protein  YP_001676592  normal  0.275699  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5159  CDS  NC_010335  74963  75919  -  957  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  YP_001676593  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5160  CDS  NC_010335  75922  77838  -  1917  TRAG family protein  YP_001676594  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5161  CDS  NC_010335  77945  78343  +  399  hypothetical protein  YP_001676595  normal  0.921581  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5162  CDS  NC_010335  78357  79853  -  1497  MobA/MobL protein  YP_001676596  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5163  CDS  NC_010335  80121  80678  +  558  hypothetical protein  YP_001676597  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5164  CDS  NC_010335  80690  81022  -  333  hypothetical protein  YP_001676598  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5165  CDS  NC_010335  81421  81642  -  222  hypothetical protein  YP_001676599  normal  1  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5166  CDS  NC_010335  82061  82813  -  753  cell wall hydrolase SleB  YP_001676600  normal  0.847272  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5167  CDS  NC_010335  82810  83340  -  531  putative conjugal transfer protein  YP_001676601  normal  0.59873  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5168  CDS  NC_010335  84190  85158  -  969  plasmid replication initiator protein-like protein  YP_001676602  normal  0.697276  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5169  CDS  NC_010335  85244  85723  -  480  hypothetical protein  YP_001676603  normal  0.527491  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5170  CDS  NC_010335  85723  86505  -  783  ParA protein, putative  YP_001676604  normal  0.433255  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5171  CDS  NC_010335  87214  87579  -  366  single-strand binding protein  YP_001676605  normal  0.159493  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5172  CDS  NC_010335  88355  89287  -  933  hypothetical protein  YP_001676606  normal  0.398041  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5173  CDS  NC_010335  89467  90033  -  567  GcrA cell cycle regulator  YP_001676607  normal  0.588722  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5174  CDS  NC_010335  90401  91333  +  933  HEPN domain-containing protein  YP_001676608  normal  0.0411727  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5175  CDS  NC_010335  91330  92229  +  900  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  YP_001676609  normal  0.631656  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5176  CDS  NC_010335  92353  92958  +  606  hypothetical protein  YP_001676610  normal  0.464751  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5177  CDS  NC_010335  93104  93688  +  585  hypothetical protein  YP_001676611  normal  0.524088  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5178  CDS  NC_010335  93765  94343  +  579  hypothetical protein  YP_001676612  normal  0.196574  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Caul_5179  CDS  NC_010335  94375  95295  +  921  hypothetical protein  YP_001676613  normal  0.168692  normal  1  Caulobacter sp. K31  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>