More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5171 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5171  single-strand binding protein  100 
 
 		 121 aa  249  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5339  single-strand binding protein  74.38 
 
 		 122 aa  191  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  44.25 
 
 		 180 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2988  single-strand binding protein  47.32 
 
 		 173 aa  88.2  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0391895 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1745  single-strand binding protein  44.64 
 
 		 185 aa  87.8  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0536308  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0796  single-strand binding protein  45.54 
 
 		 159 aa  87  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000662422 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2038  single-strand binding protein  42.62 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.663692  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1425  single-strand binding protein  45.54 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.195653  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2452  single-strand binding protein  45.22 
 
 		 195 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1676  single-strand binding protein  43.75 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  46.46 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2198  single-strand binding protein  42.15 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00537344 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2848  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.89958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2755  single-stranded DNA-binding protein  42.34 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0658877  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2755  single-stranded DNA-binding protein  41.07 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1742  single-stranded DNA-binding protein  40.18 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.366869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1927  single-stranded DNA-binding protein  40.18 
 
 		 169 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1566  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.365454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0774  single-strand binding protein  41.46 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2713  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1397  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2199  single-strand binding protein  41.07 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1102  single-stranded DNA-binding protein family  40.18 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853815  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  43.56 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2382  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1062  single-stranded DNA-binding protein family  40.18 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  42.11 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  39.5 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  40.65 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2079  single-stranded DNA-binding protein  41.44 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1884  single-strand binding protein  43.75 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0898564  normal  0.541017 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1236  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  44.09 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3154  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1606  single stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.597102  normal  0.594419 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0736  single-stranded DNA-binding protein  36.36 
 
 		 177 aa  77  0.00000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0217627  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4373  single-stranded DNA-binding protein  41.96 
 
 		 166 aa  76.6  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.394884  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  43.88 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  40.4 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3047  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564051  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  41.58 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  38.39 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1816  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0697852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  42.57 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  40.4 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  41.58 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  44.12 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3806  single-strand binding protein  41.96 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 199 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  36.07 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1885  single-strand binding protein  41.75 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110656  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  42 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  40.78 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  41.58 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  41.58 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  41.58 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  36.07 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  41.58 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  41.58 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  41.07 
 
 		 166 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0815  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  41.58 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  41.58 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  40.4 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  41.58 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  41.58 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  39.39 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 		 184 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 		 183 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 		 184 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  43.69 
 
 		 161 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  43.69 
 
 		 163 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  41.58 
 
 		 188 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 178 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  43.69 
 
 		 161 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2879  single-strand binding protein  41.44 
 
 		 165 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.561804  normal  0.0379705 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  42.57 
 
 		 184 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0539  single-strand binding protein  40.18 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0171971  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  42 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>