442 genes were found for organism Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 5    << first  < prev  1  2  3  4  5    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CNI00010  CDS  NC_006694  754  2253  -  1500  fungal specific transcription factor, putative  XP_572787  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00020  CDS  NC_006694  5006  6241  +  1236  expressed protein  XP_572755  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00030  CDS  NC_006694  8997  9664  +  668  hypothetical protein  XP_572752  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00040  CDS  NC_006694  11946  14221  -  2276  protein transporter, putative  XP_572757  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00050  CDS  NC_006694  14423  17369  +  2947  tRNA dihydrouridine synthase, putative  XP_572750  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00060  CDS  NC_006694  17697  19727  +  2031  oxidoreductase, putative  XP_572748  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00070  CDS  NC_006694  19962  21794  +  1833  expressed protein  XP_572759  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00080  CDS  NC_006694  22009  29138  +  7130  ATP-dependent bile acid transporter, putative  XP_572761  normal  0.35952  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00090  CDS  NC_006694  29416  31191  -  1776  farnesyltranstransferase, putative  XP_572774  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00100  CDS  NC_006694  31877  34460  +  2584  multidrug transporter, putative  XP_572746  normal  0.578905  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00110  CDS  NC_006694  34723  36167  +  1445  hypothetical protein  XP_572744  normal  0.854386  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00120  CDS  NC_006694  36825  37823  +  999  hypothetical protein  XP_572742  normal  0.180958  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00130  CDS  NC_006694  38022  40316  +  2295  polyadenylation factor 64 kDa subunit, putative  XP_572946  normal  0.232022  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00140  CDS  NC_006694  40490  42003  -  1514  endoplasmic reticulum receptor, putative  XP_572773  normal  0.470636  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00150  CDS  NC_006694  42222  43461  -  1240  mitochondrial protein required for respiration, putative  XP_572772  normal  0.303199  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00160  CDS  NC_006694  43627  46176  -  2550  ubiquitin-like conjugating enzyme, putative  XP_572740  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00170  CDS  NC_006694  46326  48591  +  2266  hypothetical protein  XP_572738  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00180  CDS  NC_006694  48772  51052  -  2281  nicotinamide mononucleotide permease, putative  XP_572736  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00190  CDS  NC_006694  52111  53526  +  1416  tartrate dehydrogenase, putative  XP_572763  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00200  CDS  NC_006694  56426  56876  +  451  hypothetical protein  XP_572734  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00210  CDS  NC_006694  57232  58368  -  1137  conserved hypothetical protein  XP_572771  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00220  tRNA  NC_006694  59067  59158  -  92  tRNA-Ala    normal  0.270732  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00230  CDS  NC_006694  59343  61061  -  1719  eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, putative  XP_572732  normal  0.433033  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00240  CDS  NC_006694  61307  62459  +  1153  enoyl-CoA hydratase, putative  XP_572730  normal  0.0589051  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00250  CDS  NC_006694  62644  64271  -  1628  DNA-binding protein  XP_572770  normal  0.0779011  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00260  CDS  NC_006694  64455  65037  +  583  conserved hypothetical protein  XP_572728  normal  0.530622  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00270  CDS  NC_006694  65484  68782  -  3299  hypothetical protein  XP_572967  normal  0.198438  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00280  CDS  NC_006694  68996  70323  +  1328  expressed protein  XP_572948  normal  0.17126  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00290  CDS  NC_006694  70630  72275  -  1646  hypothetical protein  XP_572965  normal  0.282974  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00300  CDS  NC_006694  72780  74817  -  2038  GPI-anchor transamidase, putative  XP_572769  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00310  CDS  NC_006694  75196  78921  +  3726  conserved hypothetical protein  XP_572764  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00320  CDS  NC_006694  79003  80640  -  1638  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase, putative  XP_572768  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00330  tRNA  NC_006694  81166  81257  -  92  tRNA-Ala    normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00340  CDS  NC_006694  81883  82702  +  820  oxidoreductase, putative  XP_572765  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00350  CDS  NC_006694  83152  84844  +  1693  expressed protein  XP_572766  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00360  CDS  NC_006694  85649  87422  +  1774  oxidoreductase, putative  XP_572726  normal  0.757288  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00370  CDS  NC_006694  89783  91870  +  2088  D-aminoacylase, putative  XP_572724  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00380  CDS  NC_006694  92371  94077  +  1707  expressed protein  XP_572767  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00390  CDS  NC_006694  94327  96918  -  2592  expressed protein  XP_572722  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00400  CDS  NC_006694  98167  100329  -  2163  expressed protein  XP_572950  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00410  CDS  NC_006694  100489  102438  -  1950  MAP kinase, putative  XP_572813  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00420  CDS  NC_006694  102727  106830  +  4104  DNA-directed RNA polymerase, putative  XP_572718  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00430  CDS  NC_006694  106980  108018  -  1039  conserved hypothetical protein  XP_572716  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00440  tRNA  NC_006694  108166  108254  -  89  tRNA-Ile    normal  0.703813  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00450  CDS  NC_006694  108569  109582  -  1014  expressed protein  XP_572789  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00460  CDS  NC_006694  109752  111552  +  1801  ATPase, putative  XP_572783  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00470  CDS  NC_006694  111862  113122  +  1261  hypothetical protein  XP_572782  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00480  CDS  NC_006694  113697  114905  -  1209  expressed protein  XP_572781  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00490  CDS  NC_006694  116202  117580  +  1379  expressed protein  XP_572791  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00500  CDS  NC_006694  118047  119533  +  1487  hypothetical protein  XP_572780  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00510  tRNA  NC_006694  119969  120057  +  89  tRNA-Ile    normal  0.688322  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00520  CDS  NC_006694  121340  123801  +  2462  G-protein alpha-subunit  XP_572793  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00530  CDS  NC_006694  124671  126967  +  2297  expressed protein  XP_572779  normal  0.775601  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00540  tRNA  NC_006694  127491  127579  -  89  tRNA-Ile    normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00550  CDS  NC_006694  128881  132628  +  3748  expressed protein  XP_572778  normal  0.187013  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00560  CDS  NC_006694  133133  135581  +  2449  anthranilate synthase, putative  XP_572795  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00570  CDS  NC_006694  135625  137954  -  2330  expressed protein  XP_572777  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00580  CDS  NC_006694  138174  139265  +  1092  clathrin light chain, putative  XP_572797  normal  0.711726  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00590  tRNA  NC_006694  139526  139615  +  90  tRNA-Ile    normal  0.345131  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00600  CDS  NC_006694  140151  143890  +  3740  alpha-1,2-mannosidase, putative  XP_572799  normal  0.749249  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00610  CDS  NC_006694  143499  145238  -  1740  expressed protein  XP_572775  normal  0.541278  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00620  CDS  NC_006694  145719  149401  -  3683  Rab GTPase activator, putative  XP_572811  normal  0.414806  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00630  CDS  NC_006694  151613  152622  -  1010  U1 small nuclear ribonucleoprotein, putative  XP_572762  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00640  CDS  NC_006694  152846  157420  +  4575  conserved hypothetical protein  XP_572952  normal  0.334737  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00650  CDS  NC_006694  158356  160409  -  2054  hypothetical protein  XP_572760  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00660  tRNA  NC_006694  161749  161830  -  82  tRNA-Gly    normal  0.576364  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00670  CDS  NC_006694  162012  163579  +  1568  pseudouridylate synthase, putative  XP_572802  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00680  CDS  NC_006694  163820  165090  +  1271  hypothetical protein  XP_572758  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00690  CDS  NC_006694  165149  166684  -  1536  ketoreductase, putative  XP_572756  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00700  CDS  NC_006694  166903  168918  +  2016  transcription regulator, putative  XP_572804  normal  0.960163  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00710  CDS  NC_006694  170879  173536  +  2658  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase, putative  XP_572754  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00720  CDS  NC_006694  173589  177348  -  3760  transporter, putative  XP_572809  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00730  CDS  NC_006694  178131  180885  +  2755  hypothetical protein  XP_572751  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00740  CDS  NC_006694  180897  183332  -  2436  hypothetical protein  XP_572954  normal  0.309758  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00750  tRNA  NC_006694  183423  183511  -  89  tRNA-Ile    normal  0.115154  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00760  CDS  NC_006694  183896  185028  +  1133  hypothetical protein  XP_572749  normal  0.149789  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00770  CDS  NC_006694  185408  187155  +  1748  expressed protein  XP_572807  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00780  CDS  NC_006694  187155  188890  -  1736  expressed protein  XP_572747  normal  0.644319  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00790  CDS  NC_006694  189106  192568  +  3463  hypothetical protein  XP_572745  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00800  CDS  NC_006694  192827  195791  +  2965  peptidase, putative  XP_572743  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00810  CDS  NC_006694  196833  200109  +  3277  expressed protein  XP_572741  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00820  CDS  NC_006694  200186  201799  -  1614  conserved hypothetical protein  XP_572972  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00830  CDS  NC_006694  205746  207378  +  1633  monocarboxylic acid transporter, putative  XP_572815  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00840  CDS  NC_006694  208651  211642  -  2992  hypothetical protein  XP_572739  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00850  CDS  NC_006694  212585  214351  -  1767  membrane protein, putative  XP_572852  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00860  CDS  NC_006694  215244  217124  +  1881  conserved hypothetical protein  XP_572737  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00870  CDS  NC_006694  217514  218426  -  913  haloacid dehalogenase, putative  XP_572850  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00880  CDS  NC_006694  219066  220892  +  1827  ornithine-oxo-acid aminotransferase, putative  XP_572817  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00890  CDS  NC_006694  221216  222853  -  1638  tartrate dehydrogenase, putative  XP_572848  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00900  CDS  NC_006694  223100  225202  +  2103  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+), putative  XP_572819  normal  0.825171  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00910  CDS  NC_006694  225592  227991  +  2400  conserved hypothetical protein  XP_572821  normal  0.65667  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00920  CDS  NC_006694  228034  229558  -  1525  small nuclear ribonucleoprotein, putative  XP_572846  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00930  CDS  NC_006694  230016  230937  +  922  hypothetical protein  XP_572735  normal  0.638625  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00940  CDS  NC_006694  231584  232075  +  492  hypothetical protein  XP_572733  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00950  CDS  NC_006694  232397  232977  -  581  hypothetical protein  XP_572731  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00960  CDS  NC_006694  233175  235286  +  2112  F-box domain-containing protein, putative  XP_572729  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00970  CDS  NC_006694  235197  241576  -  6380  DNA helicase, putative  XP_572727  normal  0.530754  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00980  CDS  NC_006694  241710  243678  -  1969  RNA polymerase II transcription factor, putative  XP_572725  normal  0.214338  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI00990  CDS  NC_006694  244034  245107  -  1074  expressed protein  XP_572844  normal  0.134845  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNI01000  CDS  NC_006694  245948  248965  +  3018  DNA helicase, putative  XP_572723  normal  0.359255  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 5    << first  < prev  1  2  3  4  5    next >  last >>