177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI00510 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006694  CNI00510  tRNA-Ile  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.688322  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00540  tRNA-Ile  98.88 
 
 		 89 bp  168  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00440  tRNA-Ile  96.63 
 
 		 89 bp  153  8e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.703813  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00750  tRNA-Ile  96.63 
 
 		 89 bp  153  8e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115154  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05230  tRNA-Ile  96.7 
 
 		 91 bp  151  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00590  tRNA-Ile  96.67 
 
 		 90 bp  147  5e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.345131  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0059  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412801  normal  0.045511 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00016  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000202389  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00018  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000172255  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00041  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000120834  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00042  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000123332  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00043  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000135072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0032  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000121865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0033  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139547  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0034  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000138641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0057  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000177997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0059  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  6.36722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t26  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.200779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t28  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.199855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t43  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0556993  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5650  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000315313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5659  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000220141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5674  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000774972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5687  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000478099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5732  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412764  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t48  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t50  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.220633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-2  tRNA-Val  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-3  tRNA-Val  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-4  tRNA-Val  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000645962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-5  tRNA-Val  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000098013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-6  tRNA-Val  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000153225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0417532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-3  tRNA-Val  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000052933  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-4  tRNA-Val  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00757095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-5  tRNA-Val  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-6  tRNA-Val  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000716932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-7  tRNA-Val  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000452768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000230232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-2  tRNA-Val  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000226351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-3  tRNA-Val  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000779763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-5  tRNA-Val  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000106447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-6  tRNA-Val  100 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394218  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA26  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.241705  normal  0.163758 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA28  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000265839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0665  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000217876  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-2  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000053562  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-3  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-4  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-6  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778849  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2837  tRNA-Val  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.88964e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0457  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21800  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000344548  normal  0.0953285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24110  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000487057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0072  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0089  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000177778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0090  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000163432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0035  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309036  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0020  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0102813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0018  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0179494 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0069  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0543632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0084  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.150766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0086  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.211919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1859  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00131515  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2039  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0018  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0022012  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0036  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0045  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0077  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0093  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000186576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0139  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4656  tRNA-Val  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.90971e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4658  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.127679999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4681  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.95676e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4682  tRNA-Val  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.8092300000000003e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4683  tRNA-Val  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.66609e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5021  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000079938  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5049  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5050  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5051  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000673895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0018  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.010388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0036  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0045  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0080  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000518886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0097  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000152963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0143  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000199332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0036  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0038  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0053  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0037  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000578787  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0038  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000627564  hitchhiker  0.00122334 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0039  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000567069  hitchhiker  0.00359795 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0070  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000583072  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0072  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560906  normal  0.267671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0767  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000989037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0769  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000076951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2554  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2555  tRNA-Val  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000393303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2556  tRNA-Val  100 
 
 		 78 bp  48.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000389314  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>