More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Val-2 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A5709  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000949158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0095  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0097  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000152963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0036  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5034  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000220203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0294  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000261183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0778  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34684e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5666  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000870426  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0139  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0045  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5633  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0853  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000111044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0170  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0237549 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5650  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000315313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5659  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000220141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5674  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000774972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5687  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000478099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5732  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0603  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000989267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0191  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000034986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-2  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000213554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-3  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-4  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000645962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-5  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000098013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Val-6  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000153225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0417532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-3  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000052933  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-4  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00757095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-5  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-6  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000716932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Val-7  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000452768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000230232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-2  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000226351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-3  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000779763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-5  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000106447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Val-6  tRNA-Val  100 
 
 
79 bp  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5725  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5819  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000675228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-1  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-2  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000053562  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-3  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-4  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Val-6  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0143  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000199332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0036  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000418472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0212  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000868799  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4774  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000014475  hitchhiker  6.83474e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4578  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000592849  normal  0.0827232 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5145  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000184879  normal  0.692523 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0527  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3227999999999999e-28 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0272  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5050  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000188833  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5003  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0018  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.010388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0045  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000240957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0018  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0022012  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0093  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000186576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0080  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000518886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5653  tRNA-Val  100 
 
 
78 bp  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000741856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0077  tRNA-Val  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000578274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0015  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0035  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0072  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0018  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00275689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0114  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0064  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0147303  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0041  tRNA-Val  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_R0077  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000309206  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0043  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0232966  normal  0.0867643 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0062  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000193695  normal  0.338495 
 
 
-
 
NC_003296  RS05382  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151411  normal  0.0932844 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0073  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385296  hitchhiker  0.0000734054 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0015  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0062  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000375232  hitchhiker  0.000000804387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0052  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000478154  hitchhiker  0.000454644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0051  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257366  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0061  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0210957  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0072  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00338762  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0080  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0573035  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0011  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0380305  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0039  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000177246  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0053  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000325055  normal  0.687052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0006  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0077  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000753043  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0004  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000214056  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0013  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0442856  hitchhiker  0.0033866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0068  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000449242  hitchhiker  0.000000587301 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0040  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0003  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_R0080  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000119822  normal  0.781959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0060  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000596545  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0079  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  normal  0.0302308 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0018  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0060  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.245921 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0008  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000503883  normal  0.923056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0053  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0417957  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0063  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0006  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118096  hitchhiker  0.00000272915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0028  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101563  normal  0.86399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0011  tRNA-Ala  95.89 
 
 
76 bp  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.620126  normal  0.156635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>