257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0084 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0084  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0496733  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2078  hypothetical protein  44.74 
 
 
195 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2068  hypothetical protein  44.74 
 
 
195 aa  175  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0186  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  31.58 
 
 
213 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0521  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.53 
 
 
214 aa  112  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.745375  hitchhiker  0.00802215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02996  pyridoxine 5-phosphate oxidase  30.89 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2893  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30 
 
 
213 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0332  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.53 
 
 
211 aa  104  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.207205 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1481  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30 
 
 
217 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185446  normal  0.265561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.53 
 
 
212 aa  99.8  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.410968  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0423  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.53 
 
 
211 aa  99  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190408  normal  0.079885 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1519  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.32 
 
 
214 aa  99  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000729179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4754  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.84 
 
 
200 aa  95.9  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.1157  normal  0.0209318 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0443  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.32 
 
 
218 aa  95.5  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.732477  normal  0.141335 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2372  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.42 
 
 
229 aa  95.1  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11923  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.59 
 
 
213 aa  94.7  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1006  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  26.32 
 
 
217 aa  94.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3221  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.65 
 
 
213 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110352  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1053  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.32 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2153  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.95 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0248  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.1 
 
 
221 aa  92.8  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.32 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.932005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0116  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.72 
 
 
224 aa  93.2  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1311  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.79 
 
 
233 aa  92.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279184  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1067  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.42 
 
 
211 aa  92.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1988  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.14 
 
 
196 aa  92  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145695  normal  0.0355751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4533  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.23 
 
 
202 aa  91.7  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1900  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.08 
 
 
215 aa  91.3  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225533  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.8 
 
 
217 aa  91.3  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0155  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.79 
 
 
211 aa  90.9  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.923059  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1262  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.75 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2477  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.74 
 
 
212 aa  90.5  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00062859  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4813  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.74 
 
 
214 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  0.171584 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3586  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.75 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.63325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2922  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.32 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.969034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1263  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.27 
 
 
231 aa  89.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0514  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.8 
 
 
212 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.439872  normal  0.298122 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2888  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  30.37 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877962  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0021  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.84 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.479852  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4295  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.26 
 
 
214 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01608  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.32 
 
 
218 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2002  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.32 
 
 
218 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07092  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.84 
 
 
211 aa  89.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01598  hypothetical protein  26.32 
 
 
218 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001014  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.84 
 
 
211 aa  89  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1714  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.32 
 
 
218 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25 
 
 
215 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4664  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.26 
 
 
214 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187726 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1991  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.32 
 
 
218 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0163  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.26 
 
 
211 aa  89  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2218  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.79 
 
 
217 aa  89  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1561  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.79 
 
 
218 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2555  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.32 
 
 
217 aa  88.6  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185253  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1772  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.79 
 
 
217 aa  88.2  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.382068  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2350  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.79 
 
 
218 aa  88.2  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0623202  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0741  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.6 
 
 
213 aa  88.2  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643542  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1810  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.32 
 
 
218 aa  88.2  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00431301  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1618  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.26 
 
 
218 aa  88.2  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.401608  normal  0.71127 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1545  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.26 
 
 
218 aa  88.2  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.435189  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1726  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.26 
 
 
218 aa  88.2  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0190742  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1558  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.26 
 
 
218 aa  88.2  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.574434 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1895  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.26 
 
 
218 aa  88.2  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2258  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.26 
 
 
212 aa  87.8  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.182808  normal  0.591941 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0512  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.6 
 
 
221 aa  87.8  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32246  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3773  Pyridoxal 5'-phosphate synthase  28.88 
 
 
216 aa  87.8  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1880  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.32 
 
 
240 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.863598  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3147  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.11 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0321619  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1848  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.79 
 
 
218 aa  87  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000320957  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0885  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.74 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8786  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.34 
 
 
231 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4707  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.52 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1830  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.79 
 
 
218 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1068  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  23.68 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326405  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2627  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.64 
 
 
201 aa  85.9  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752106  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2277  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.26 
 
 
212 aa  85.9  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858541  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1702  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  23.68 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0601  hypothetical protein  27.89 
 
 
215 aa  85.5  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2662  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.21 
 
 
227 aa  85.5  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0604494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0557  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.18 
 
 
214 aa  85.5  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.365319  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0829  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  23.68 
 
 
212 aa  85.5  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2100  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.79 
 
 
210 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00869837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0957  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.8 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0930  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.8 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1159  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  29.32 
 
 
216 aa  85.1  5e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0582  hypothetical protein  27.89 
 
 
215 aa  85.1  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3853  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.54 
 
 
215 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0541085  normal  0.804089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4168  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.5 
 
 
217 aa  84.7  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1961  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.26 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985992  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.75 
 
 
214 aa  84.7  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0424  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.98 
 
 
261 aa  84.7  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.97035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1726  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.74 
 
 
232 aa  84.3  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.230905  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  26.7 
 
 
214 aa  84.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4331  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.48 
 
 
215 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1626  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  24.21 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0502858 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2989  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.23 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.274237  normal  0.310077 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1782  pyridoxamine-phosphate oxidase  24.73 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0835  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.42 
 
 
239 aa  84  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0417  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  28.12 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  27.23 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.41957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0790  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  25.52 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.150003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>