112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0231 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0231  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  464  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0232  hypothetical protein  99.12 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2893  Mammalian cell entry related domain protein  29.96 
 
 		 548 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.3428  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0530  Mammalian cell entry related domain protein  27.52 
 
 		 547 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0517  Mammalian cell entry related domain protein  27.52 
 
 		 547 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0601  hypothetical protein  29.55 
 
 		 547 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.184325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  24.44 
 
 		 556 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000538523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  27.24 
 
 		 533 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  24.61 
 
 		 555 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  25.94 
 
 		 558 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0040  Mammalian cell entry related domain protein  23.24 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0651  hypothetical protein  28.8 
 
 		 534 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1317  normal  0.879007 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  26.42 
 
 		 537 aa  72.4  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1056  Mammalian cell entry related domain protein  24.83 
 
 		 322 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  26.02 
 
 		 546 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0227  hypothetical protein  27.64 
 
 		 539 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0711  hypothetical protein  27.64 
 
 		 539 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0678  hypothetical protein  27.64 
 
 		 539 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0419217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1230  Mammalian cell entry related domain protein  28.77 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0602  hypothetical protein  27.24 
 
 		 539 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.483664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0626  hypothetical protein  27.24 
 
 		 539 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2679  hypothetical protein  27.39 
 
 		 546 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0040  paraquat-inducible protein  24.21 
 
 		 569 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00684202  normal  0.214843 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2114  Mammalian cell entry related domain protein  27 
 
 		 539 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3799  hypothetical protein  27.64 
 
 		 539 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  24.6 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  25 
 
 		 545 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  21.93 
 
 		 572 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0709  Mammalian cell entry related domain protein  26.78 
 
 		 552 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.381837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1268  paraquat-inducible protein B  27.08 
 
 		 551 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4000  putative paraquat-inducible protein  26.67 
 
 		 552 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.113556  normal  0.829107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2535  hypothetical protein  26.56 
 
 		 544 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1570  hypothetical protein  25.88 
 
 		 538 aa  62.4  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0668  hypothetical protein  24.92 
 
 		 330 aa  62  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2674  hypothetical protein  26.42 
 
 		 539 aa  62  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531712  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2378  paraquat-inducible protein B  25.83 
 
 		 553 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3340  paraquat-inducible protein B  25.83 
 
 		 551 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440052  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3382  paraquat-inducible protein  25.83 
 
 		 551 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0292  paraquat-inducible protein B  25.83 
 
 		 551 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1154  paraquat-inducible protein B  25.83 
 
 		 551 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3374  mce family protein  25.83 
 
 		 551 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2561  mce family protein  25.83 
 
 		 551 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2127  putative paraquat-inducible transmembrane protein, PqiB  26.16 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460028  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5278  hypothetical protein  27.27 
 
 		 531 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  24.07 
 
 		 559 aa  59.7  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2113  hypothetical protein  26.79 
 
 		 554 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.696493  normal  0.025726 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1865  hypothetical protein  26.79 
 
 		 554 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0867784 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00955  paraquat-inducible protein B  29.49 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2692  Mammalian cell entry related domain protein  29.49 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000610454  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00962  hypothetical protein  29.49 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000379419  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1983  hypothetical protein  25.25 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.042136  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4088  paraquat-inducible protein B  24.27 
 
 		 508 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1060  paraquat-inducible protein B  29.49 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1066  paraquat-inducible protein B  29.49 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000823988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2645  paraquat-inducible protein B  29.49 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000298494  hitchhiker  0.00000476211 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2168  paraquat-inducible protein B  29.49 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000764872  normal  0.254429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1115  paraquat-inducible protein B  29.49 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1960  hypothetical protein  24.92 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0139154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2366  paraquat-inducible protein B  29.49 
 
 		 546 aa  56.6  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  26.23 
 
 		 548 aa  56.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2831  hypothetical protein  26.77 
 
 		 551 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  24.78 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1920  hypothetical protein  26.32 
 
 		 554 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.976156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3535  hypothetical protein  25.82 
 
 		 531 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1704  hypothetical protein  27.75 
 
 		 554 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3179  PqiB family protein  25.62 
 
 		 559 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3045  PqiB family protein  26.45 
 
 		 559 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114944  normal  0.0226159 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  26.14 
 
 		 548 aa  53.9  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2447  hypothetical protein  24.2 
 
 		 323 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106785  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003028  paraquat-inducible protein B  24.1 
 
 		 548 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1463  paraquat-inducible protein B  25.81 
 
 		 545 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0560595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1713  hypothetical protein  22.37 
 
 		 356 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000187754 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1127  paraquat-inducible protein B  27.31 
 
 		 546 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0201216  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1352  paraquat-inducible protein B  28.5 
 
 		 547 aa  52.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273869  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1173  paraquat-inducible protein B  27.31 
 
 		 546 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1022  paraquat-inducible protein B  27.31 
 
 		 546 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1139  paraquat-inducible protein B  27.31 
 
 		 546 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  21.83 
 
 		 546 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5802  hypothetical protein  24.79 
 
 		 531 aa  51.6  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00328946  hitchhiker  0.0014272 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1105  paraquat-inducible protein B  28.24 
 
 		 546 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486337  normal  0.0294366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  23.14 
 
 		 546 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2722  paraquat-inducible protein B  24.1 
 
 		 550 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2067  paraquat-inducible protein B  27.07 
 
 		 546 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.883854  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1794  paraquat-inducible protein B  26.2 
 
 		 555 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02851  hypothetical protein  26.98 
 
 		 548 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2580  hypothetical protein  25.2 
 
 		 551 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.732971 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0366  paraquat-inducible protein B  26.17 
 
 		 547 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.838729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4853  paraquat-inducible protein B  26.17 
 
 		 547 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  25.09 
 
 		 537 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2416  hypothetical protein  21.1 
 
 		 359 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  22.31 
 
 		 546 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  25.82 
 
 		 547 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  22.89 
 
 		 543 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2074  hypothetical protein  31.2 
 
 		 550 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0955309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4623  hypothetical protein  27.03 
 
 		 334 aa  48.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  25.6 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2549  paraquat-inducible protein B  26.22 
 
 		 550 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0824615  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  26.22 
 
 		 550 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2638  paraquat-inducible protein B  26.22 
 
 		 550 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3499  hypothetical protein  31.19 
 
 		 324 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>