139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1318 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1318  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  615  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1321  hypothetical protein  95.65 
 
 
299 aa  595  1e-169  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0858  hypothetical protein  41.69 
 
 
324 aa  222  7e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000626583 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3261  D-cysteine desulfhydrase  27.65 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2011  D-cysteine desulfhydrase  27.18 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2992  D-cysteine desulfhydrase  27.65 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3241  D-cysteine desulfhydrase  27.65 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0699  D-cysteine desulfhydrase  27.08 
 
 
312 aa  75.5  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0723  D-cysteine desulfhydrase  27.08 
 
 
312 aa  75.5  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000361727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3005  D-cysteine desulfhydrase  26.47 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3236  D-cysteine desulfhydrase  26.47 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3263  D-cysteine desulfhydrase  27.65 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1217  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.14 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.6801  normal  0.977815 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2930  D-cysteine desulfhydrase  27.65 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3235  D-cysteine desulfhydrase  27.18 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2951  D-cysteine desulfhydrase  26.37 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3031  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  24.3 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.857502  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6456  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.35 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.379637 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  26.06 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5532  D-cysteine desulfhydrase  23.83 
 
 
343 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.1518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5479  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.87 
 
 
337 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0709789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2937  D-cysteine desulfhydrase  25.34 
 
 
330 aa  63.5  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4580  putative D-cysteine desulfhydrase  23.28 
 
 
319 aa  63.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0941  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  25.77 
 
 
335 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0406  D-cysteine desulfhydrase  24.5 
 
 
334 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5397  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.15 
 
 
338 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0993744  normal  0.0379152 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5856  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.7 
 
 
337 aa  62.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0688511  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5155  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.36 
 
 
338 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.331859  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6869  D-cysteine desulfhydrase  24.91 
 
 
359 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1212  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.51 
 
 
338 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0968144  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4493  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.32 
 
 
338 aa  62.8  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.117981 
 
 
-
 
NC_003296  RS05576  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.83 
 
 
338 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1912  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  24.92 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1663  D-cysteine desulfhydrase  23.82 
 
 
336 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000049313  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28382  predicted protein  24.31 
 
 
365 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.226671  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0413  D-cysteine desulfhydrase  23.89 
 
 
334 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.486407  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5405  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.83 
 
 
338 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.828504 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2860  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.36 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3150  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.15 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.768624  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0271  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.9 
 
 
337 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3877  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.15 
 
 
356 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.81785 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0604  D-cysteine desulfhydrase  23.1 
 
 
332 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7821  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.72 
 
 
338 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0753  D-cysteine desulfhydrase, PLP-dependent enzyme  21.38 
 
 
318 aa  59.7  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1521  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.47 
 
 
336 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3623  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.92 
 
 
338 aa  59.3  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3308  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.68 
 
 
338 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.0253505 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0952  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.37 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114665  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0344  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.37 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0518  hypothetical protein  26.79 
 
 
283 aa  58.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0124166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3828  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.15 
 
 
342 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.961032  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0426  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.37 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0218  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.37 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.717443  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1880  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.37 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1795  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.37 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.478026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1385  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.37 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0995718  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1439  D-cysteine desulfhydrase  23.28 
 
 
347 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.457826  normal  0.632152 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2666  D-cysteine desulfhydrase  24.66 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1101  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.04 
 
 
338 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210998  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0697  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.73 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3500  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.18 
 
 
338 aa  56.6  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1697  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.12 
 
 
338 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2004  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  24.12 
 
 
338 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.876567  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2275  D-cysteine desulfhydrase  25.17 
 
 
330 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2377  D-cysteine desulfhydrase  25.17 
 
 
339 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3582  D-cysteine desulfhydrase  23.51 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2030  D-cysteine desulfhydrase  25.17 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5099  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.68 
 
 
338 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3598  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.51 
 
 
338 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.73002 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4164  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  23.47 
 
 
339 aa  54.3  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4142  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.22 
 
 
338 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.77171  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5444  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.68 
 
 
310 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2581  D-cysteine desulfhydrase  23.49 
 
 
333 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525939  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5266  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, D- cysteine desulfhydrase family  22.97 
 
 
337 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2168  D-cysteine desulfhydrase  24.83 
 
 
328 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.406051  hitchhiker  0.0000160197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1167  D-cysteine desulfhydrase  24.83 
 
 
328 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1290  D-cysteine desulfhydrase  24.83 
 
 
328 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4127  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  20.06 
 
 
339 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2115  D-cysteine desulfhydrase  24.83 
 
 
328 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000146031 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4794  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  21.86 
 
 
338 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2109  D-cysteine desulfhydrase  24.83 
 
 
328 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497431  normal  0.0120182 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3374  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  21.86 
 
 
338 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1781  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase-like protein  23.97 
 
 
312 aa  53.1  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1836  D-cysteine desulfhydrase  24.41 
 
 
332 aa  52.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4836  D-cysteine desulfhydrase  21.59 
 
 
322 aa  52.8  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1895  putative D-cysteine desulfhydrase (DcyD)  22.68 
 
 
310 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0834874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2636  D-cysteine desulfhydrase  22.36 
 
 
335 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0359  D-cysteine desulfhydrase  25.17 
 
 
332 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0245  D-cysteine desulfhydrase  22.71 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.944644  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2693  D-cysteine desulfhydrase  26.76 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102426  normal  0.0614251 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4875  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  21.72 
 
 
331 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338198  normal  0.0605398 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6848  D-cysteine desulfhydrase  20.82 
 
 
342 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.368469 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0703  hypothetical protein  30.34 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1801  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase  22.4 
 
 
338 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2577  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.4 
 
 
287 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2169  D-cysteine desulfhydrase  24.5 
 
 
345 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1576  hypothetical protein  26.84 
 
 
307 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153483  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0628  hypothetical protein  30.34 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2357  D-cysteine desulfhydrase  22.19 
 
 
335 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.344749 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2515  D-cysteine desulfhydrase  23.75 
 
 
340 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>