More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1816 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1816  toluene tolerance protein  100 
 
 		 264 aa  518  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1748  ABC transporter related  98.86 
 
 		 264 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.751418  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03211  ABC transporter ATP-binding protein  80.77 
 
 		 264 aa  414  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4016  ABC transporter related  78 
 
 		 265 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.304399  normal  0.276484 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  55.65 
 
 		 261 aa  270  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  52.23 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  51.42 
 
 		 269 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  51.01 
 
 		 270 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.42 
 
 		 269 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  52.63 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  50.4 
 
 		 269 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  50.4 
 
 		 269 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  52.03 
 
 		 270 aa  265  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  51.01 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  51.01 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  51.01 
 
 		 269 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  51.01 
 
 		 269 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  51.79 
 
 		 276 aa  261  6e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  52.8 
 
 		 275 aa  260  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  54.66 
 
 		 277 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  54.66 
 
 		 277 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 277 aa  254  7e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  50.2 
 
 		 270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2120  ABC transporter related  54.8 
 
 		 274 aa  252  4.0000000000000004e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  48.58 
 
 		 265 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  50.6 
 
 		 264 aa  251  6e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  50.41 
 
 		 274 aa  250  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.41 
 
 		 276 aa  250  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2962  ABC transporter ATP-binding protein  51 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  46.27 
 
 		 267 aa  249  3e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  50.81 
 
 		 286 aa  248  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  48.26 
 
 		 273 aa  248  6e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  46.75 
 
 		 266 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  50.81 
 
 		 286 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  47.89 
 
 		 293 aa  246  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  49.4 
 
 		 286 aa  245  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  48.28 
 
 		 265 aa  245  6e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  49.4 
 
 		 306 aa  244  9e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  49.4 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  51.6 
 
 		 279 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  47.89 
 
 		 265 aa  243  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  48.78 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0759  ABC transporter related protein  50.62 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  50 
 
 		 282 aa  242  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  51.05 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.56 
 
 		 270 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2220  ABC transporter related  50.4 
 
 		 283 aa  242  5e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  46.99 
 
 		 268 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  46.39 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  52.16 
 
 		 273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  47.01 
 
 		 270 aa  239  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  49.22 
 
 		 273 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  50.81 
 
 		 278 aa  239  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  49.8 
 
 		 273 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  48.83 
 
 		 273 aa  235  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1190  ATP-binding ABC transporter protein  48.75 
 
 		 281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3808  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  52.03 
 
 		 269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  50.2 
 
 		 273 aa  234  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  50.2 
 
 		 273 aa  234  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0512  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  50.41 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  50.2 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0448  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  50.41 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.885469  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  50.2 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  50.2 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1146  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  50.41 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  50.2 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  48.78 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0281  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  49.8 
 
 		 270 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0561  ABC transporter related  48.37 
 
 		 265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03186  putative transport protein (ABC superfamily, atp-binding)  48.78 
 
 		 266 aa  232  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  50 
 
 		 283 aa  232  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  48.22 
 
 		 309 aa  232  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  49.02 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4360  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  50.81 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.132306  normal  0.0534611 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 272 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 272 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  50.62 
 
 		 272 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 272 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 272 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 272 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0505  toluene tolerance protein Ttg2A  48.78 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0288  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  48.59 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  48.58 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3304  ABC transporter-related protein  47.18 
 
 		 292 aa  226  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03658  hypothetical protein  46.88 
 
 		 267 aa  225  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2887  ABC transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 		 269 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.220334  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002409  ABC transporter ATP-binding protein  46.88 
 
 		 267 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3650  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  49.19 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0678  ABC transporter related  46.18 
 
 		 272 aa  222  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0646516 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0721  ABC transporter related  46.59 
 
 		 272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0496  ABC transporter related  45.6 
 
 		 273 aa  222  6e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00107814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4233  ABC transporter related  46 
 
 		 271 aa  221  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.36582  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3343  ABC transporter related  44.4 
 
 		 272 aa  221  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0679  ABC transporter related  44.4 
 
 		 272 aa  221  9e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.962432 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3954  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.02 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0722  ABC transporter related  46.18 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.165434 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3370  ABC transporter related  46.37 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3662  ABC transporter related  46.18 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>