74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0929 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0929  phenylacetate-coenzyme A ligase (phenylacetyl-CoA ligase) (PA-CoA ligase)  100 
 
 		 129 aa  269  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3669  coenzyme F390 synthetase  50.43 
 
 		 473 aa  97.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1038  hypothetical protein  43.48 
 
 		 471 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.888049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3322  hypothetical protein  34.55 
 
 		 445 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.985105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  38.04 
 
 		 461 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0627  coenzyme F390 synthetase  44.19 
 
 		 448 aa  53.9  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.33 
 
 		 436 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  32.18 
 
 		 450 aa  50.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  36.78 
 
 		 434 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  34.83 
 
 		 433 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  37 
 
 		 434 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  36 
 
 		 434 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  33.71 
 
 		 433 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  41.67 
 
 		 434 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  30.59 
 
 		 524 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3550  phenylacetate-CoA ligase  41.67 
 
 		 432 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489447  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3577  phenylacetate-CoA ligase  41.67 
 
 		 432 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0226  coenzyme F390 synthetase  40 
 
 		 454 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3568  phenylacetate-CoA ligase  41.67 
 
 		 432 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172482  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  33.33 
 
 		 438 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1905  phenylacetate-coenzyme A ligase  41.67 
 
 		 432 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511484  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0935  phenylacetate-coenzyme A ligase  41.67 
 
 		 432 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1546  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.34 
 
 		 443 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  30.53 
 
 		 433 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0638  phenylacetate-CoA ligase  41.67 
 
 		 432 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100652  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  41.67 
 
 		 434 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  35 
 
 		 440 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539  phenylacetate-coenzyme A ligase  41.67 
 
 		 432 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0321632  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  30 
 
 		 433 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  35 
 
 		 440 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  35 
 
 		 434 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 		 434 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  30.61 
 
 		 434 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  35.48 
 
 		 467 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  33.71 
 
 		 432 aa  44.3  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  35 
 
 		 432 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  32.1 
 
 		 433 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  35.53 
 
 		 436 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 		 435 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  34 
 
 		 432 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  33 
 
 		 434 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  35 
 
 		 429 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  31.46 
 
 		 433 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  28.57 
 
 		 434 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2875  phenylacetyl-CoA-ligase protein  40.28 
 
 		 436 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0228707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  31.46 
 
 		 433 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  31.11 
 
 		 431 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  34 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  23.88 
 
 		 462 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  33 
 
 		 440 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  30.34 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1845  phenylacetate-CoA ligase  35.19 
 
 		 440 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  34 
 
 		 432 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  38.71 
 
 		 449 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  38.89 
 
 		 432 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  33 
 
 		 432 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  27.78 
 
 		 435 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  26.67 
 
 		 445 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  29.73 
 
 		 439 aa  41.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  31.96 
 
 		 431 aa  41.2  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0437  Phenylacetate--CoA ligase  33.7 
 
 		 435 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288534  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  33 
 
 		 441 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  28.89 
 
 		 433 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0388  phenylacetate-CoA ligase  40 
 
 		 427 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.128203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  36.47 
 
 		 436 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  28.09 
 
 		 432 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  33 
 
 		 434 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  34.72 
 
 		 432 aa  40.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  28.09 
 
 		 432 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  28.09 
 
 		 432 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  32 
 
 		 440 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  32 
 
 		 440 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  37.5 
 
 		 434 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  36.11 
 
 		 439 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>