92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_R0064 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_R0064  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02010  tRNA-Ser  95.6 
 
 		 92 bp  149  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0005  tRNA-Ser  86.96 
 
 		 92 bp  87.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0006  tRNA-Ser  93.02 
 
 		 90 bp  61.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.033813  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0043  tRNA-Ser  97.06 
 
 		 93 bp  60  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.569209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0006  tRNA-Ser  87.1 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286369  normal  0.0478712 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26110  tRNA-Ser  100 
 
 		 95 bp  58  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0010  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.841782  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0013  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0021  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.753643 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Ser-2  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0114539  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0059  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00785385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0049  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.53957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0018  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0006  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0027  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113277  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0046  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.574265  normal  0.350655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA23  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658425  normal  0.252168 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2538  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.536937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1426  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2590  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0059  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.233723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0030  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0051  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0325227  normal  0.449297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0029  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0112304  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0013  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0131326  normal  0.0455197 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0006  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0023  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.309507  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0027  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.614719  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0018  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0346344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0008  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0016  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.59957 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0068  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 96 bp  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0018  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 92 bp  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0238889  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0014  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010946  hitchhiker  0.00318065 
 
 
-
 
NC_003295  RS04528  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0104134  normal  0.589043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0066  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00121253  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0009  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00103518  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0025  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2675  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1946  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0042  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0039  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0368673  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0046  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960989  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0038  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0537085  normal  0.0209317 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3162  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.635575  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0091  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0220813  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0059  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0057  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2153  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0007  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000625255  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0023  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0004  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0010  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0597346  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0018  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.648957  normal  0.166576 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0063  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.6315500000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0056  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0268608  normal  0.036349 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000207344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0014  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000003248  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0018  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0208522  hitchhiker  0.00000010286 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0067  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198347  normal  0.511867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0006  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.990082  normal  0.413078 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0047  tRNA-Cys  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0027  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000116718  hitchhiker  6.42112e-17 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0038  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0662946  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0009  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.509163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0060  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0060  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0055  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0053  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0980928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4302  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0357702  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0008  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.201006 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0002  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 95 bp  44.1  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0021  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.690365 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0010  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000388656  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0030  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.924636  hitchhiker  0.0000671123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0008  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0056  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133866  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0044  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0004  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0039  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0004  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0006  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214474  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0038  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0029  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0015  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 91 bp  44.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0033  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0043  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 93 bp  44.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.626616  normal  0.0403391 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0011  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 96 bp  44.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000117466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0008  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 96 bp  44.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000013912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0020  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.417129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14042  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.417053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>