131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3220 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  100 
 
 
711 aa  1365    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  51.95 
 
 
708 aa  598  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  50.28 
 
 
722 aa  546  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  46.82 
 
 
687 aa  533  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  52.16 
 
 
683 aa  512  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  42.57 
 
 
718 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  43.12 
 
 
718 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  43.99 
 
 
752 aa  474  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  45.51 
 
 
671 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  40.54 
 
 
697 aa  428  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  42.24 
 
 
708 aa  403  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  41.89 
 
 
739 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  40.43 
 
 
631 aa  391  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  39.31 
 
 
678 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  37.88 
 
 
651 aa  372  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  39.8 
 
 
681 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  37.72 
 
 
731 aa  354  4e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  40.33 
 
 
686 aa  349  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  36.69 
 
 
664 aa  347  6e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  37.48 
 
 
665 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  37.48 
 
 
665 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  37.34 
 
 
665 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  37.9 
 
 
687 aa  343  8e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  37.34 
 
 
671 aa  339  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  37.73 
 
 
692 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.73 
 
 
675 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  41.19 
 
 
719 aa  327  5e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  35.61 
 
 
691 aa  318  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  39.31 
 
 
651 aa  310  6.999999999999999e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  35.72 
 
 
672 aa  308  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  38.76 
 
 
679 aa  306  8.000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  35.04 
 
 
736 aa  306  9.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  35.31 
 
 
676 aa  277  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  45.13 
 
 
661 aa  274  5.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  35.32 
 
 
632 aa  246  9e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  32.25 
 
 
653 aa  213  7.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  29.12 
 
 
646 aa  212  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  31.14 
 
 
642 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40.85 
 
 
319 aa  211  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  38.78 
 
 
310 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  30.08 
 
 
641 aa  193  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  30.08 
 
 
641 aa  193  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.96 
 
 
654 aa  189  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  29.29 
 
 
637 aa  187  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  39.31 
 
 
328 aa  185  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  36.78 
 
 
651 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  40.14 
 
 
319 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  38.64 
 
 
322 aa  173  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  36.69 
 
 
322 aa  170  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  35.87 
 
 
322 aa  152  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  35.51 
 
 
331 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  35.51 
 
 
331 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  35.51 
 
 
326 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  35.51 
 
 
331 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  35.51 
 
 
308 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  33.69 
 
 
307 aa  128  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.58 
 
 
613 aa  125  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  34.65 
 
 
273 aa  115  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  30.16 
 
 
387 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  31.21 
 
 
327 aa  104  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  32.23 
 
 
394 aa  103  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  32.36 
 
 
354 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  23.6 
 
 
274 aa  92.4  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.67 
 
 
326 aa  92.4  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  23.05 
 
 
277 aa  90.5  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  23.05 
 
 
277 aa  90.5  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  22.73 
 
 
265 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  23.6 
 
 
277 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  23.22 
 
 
277 aa  87.8  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  29.39 
 
 
254 aa  87.8  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21060  predicted membrane protein  33.99 
 
 
277 aa  72  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  30.77 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  31.46 
 
 
343 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  30.47 
 
 
604 aa  68.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  29.17 
 
 
549 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  28.31 
 
 
544 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  29.17 
 
 
544 aa  64.7  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  29.17 
 
 
544 aa  64.7  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  29.17 
 
 
544 aa  64.7  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  28.72 
 
 
547 aa  64.3  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  28.57 
 
 
439 aa  64.3  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3086  hypothetical protein  37.11 
 
 
235 aa  63.9  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0589331  hitchhiker  0.00886483 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  27.78 
 
 
547 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  27.68 
 
 
270 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  31.62 
 
 
246 aa  63.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  31.64 
 
 
339 aa  63.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  29.17 
 
 
547 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  26.51 
 
 
549 aa  61.2  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  27.74 
 
 
319 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  29.05 
 
 
328 aa  53.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  28.62 
 
 
316 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  29.77 
 
 
869 aa  52.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  35.14 
 
 
564 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.08 
 
 
309 aa  52  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3766  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  24.62 
 
 
301 aa  51.2  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  28.27 
 
 
298 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  34.23 
 
 
565 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2642  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  29.6 
 
 
301 aa  49.7  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  26.69 
 
 
317 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1859  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  26.74 
 
 
300 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>