More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1007 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1007  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  100 
 
 
480 aa  922    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25570  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  77.59 
 
 
495 aa  656    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.302266  normal  0.390053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2932  flavoprotein disulfide reductase  72.38 
 
 
491 aa  605  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316087  hitchhiker  0.00133507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1032  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  70.68 
 
 
506 aa  585  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.639755 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0836  flavoprotein disulfide reductase  65.74 
 
 
491 aa  584  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.801746  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3918  flavoprotein disulfide reductase  66.23 
 
 
479 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0748813  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0806  flavoprotein disulfide reductase  62.5 
 
 
471 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21170  flavoprotein disulfide reductase  61.66 
 
 
468 aa  512  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0696  flavoprotein disulfide reductase  59.55 
 
 
493 aa  512  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3517  flavoprotein disulfide reductase  61.96 
 
 
465 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0548483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0689  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  61.97 
 
 
463 aa  501  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4180  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  61.97 
 
 
460 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1360  flavoprotein disulfide reductase  60.78 
 
 
468 aa  504  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.538341  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1309  flavoprotein disulfide reductase  61.09 
 
 
471 aa  503  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000251684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1285  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.81 
 
 
464 aa  501  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1263  flavoprotein disulfide reductase  61.09 
 
 
478 aa  504  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3950  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  60.96 
 
 
481 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5930  flavoprotein disulfide reductase  62.71 
 
 
483 aa  498  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0274379  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05640  flavoprotein disulfide reductase  59.18 
 
 
476 aa  496  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0782  flavoprotein disulfide reductase  58.82 
 
 
470 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00538135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0837  flavoprotein disulfide reductase  58.82 
 
 
467 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2559  flavoprotein disulfide reductase  61.05 
 
 
460 aa  490  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.226761  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05750  flavoprotein disulfide reductase  59.65 
 
 
467 aa  471  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0394  flavoprotein disulfide reductase  63.02 
 
 
463 aa  473  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4370  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  60.87 
 
 
467 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6404  flavoprotein disulfide reductase  58.48 
 
 
467 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08180  flavoprotein disulfide reductase  58.7 
 
 
478 aa  462  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234528  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0989  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  56.77 
 
 
467 aa  457  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1619  flavoprotein disulfide reductase  54.6 
 
 
495 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  0.0187894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13332  flavoprotein disulfide reductase  55.46 
 
 
471 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4822  flavoprotein disulfide reductase  55.25 
 
 
471 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.756174  normal  0.061332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1249  flavoprotein disulfide reductase  55.48 
 
 
470 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0779  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  55.02 
 
 
463 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1266  flavoprotein disulfide reductase  55.48 
 
 
470 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1276  flavoprotein disulfide reductase  55.27 
 
 
470 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.304931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1792  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  55.99 
 
 
467 aa  435  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.11 
 
 
465 aa  252  8.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.18 
 
 
470 aa  246  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.87 
 
 
458 aa  240  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.44 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.44 
 
 
459 aa  231  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.02 
 
 
465 aa  230  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.17 
 
 
459 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.56 
 
 
459 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.56 
 
 
459 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.62 
 
 
465 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  32 
 
 
459 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.68 
 
 
471 aa  227  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.58 
 
 
459 aa  227  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.95 
 
 
462 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.17 
 
 
458 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.35 
 
 
459 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.6 
 
 
468 aa  224  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.35 
 
 
466 aa  224  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.49 
 
 
562 aa  223  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.44 
 
 
470 aa  223  6e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.96 
 
 
464 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.53 
 
 
459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.82 
 
 
465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.82 
 
 
471 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.82 
 
 
464 aa  220  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 
459 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.87 
 
 
474 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.94 
 
 
471 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
459 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  35.81 
 
 
468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  31.07 
 
 
464 aa  216  7e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.25 
 
 
467 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.38 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.87 
 
 
463 aa  215  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.61 
 
 
465 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.3 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.24 
 
 
480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.89 
 
 
468 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.97 
 
 
462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  31 
 
 
470 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.4 
 
 
464 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.13 
 
 
465 aa  213  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.09 
 
 
468 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.2 
 
 
462 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.47 
 
 
470 aa  212  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 
468 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  31 
 
 
465 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.32 
 
 
465 aa  211  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3518  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.32 
 
 
464 aa  209  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.1 
 
 
463 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
466 aa  209  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.09 
 
 
459 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.7 
 
 
470 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.54 
 
 
464 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.24 
 
 
468 aa  208  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.76 
 
 
473 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.82 
 
 
581 aa  206  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3549  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
468 aa  206  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.18 
 
 
459 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.03 
 
 
466 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.41 
 
 
466 aa  205  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1079  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  28.54 
 
 
473 aa  204  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.95 
 
 
466 aa  203  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>