26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4201 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4201  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  586  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2476  hypothetical protein  45.64 
 
 
291 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2785  hypothetical protein  46.48 
 
 
289 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0719299  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2821  hypothetical protein  46.83 
 
 
289 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.612498  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3224  hypothetical protein  43.9 
 
 
297 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.643218  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1070  hypothetical protein  33.56 
 
 
296 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12114  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2106  hypothetical protein  27.72 
 
 
283 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1599  hypothetical protein  30.66 
 
 
298 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647468  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1792  hypothetical protein  39.13 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0409814  hitchhiker  0.00116581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1036  hypothetical protein  28.14 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1147  hypothetical protein  27.12 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0434891 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2750  hypothetical protein  26.71 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2890  hypothetical protein  26.47 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4332  hypothetical protein  28.14 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318075  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0511  hypothetical protein  25.26 
 
 
297 aa  72  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3322  hypothetical protein  27.21 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470211  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1825  hypothetical protein  23.24 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0283  hypothetical protein  30 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3085  hypothetical protein  27.04 
 
 
287 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.422699  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2976  hypothetical protein  25.17 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5820  hypothetical protein  25.27 
 
 
270 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330441  normal  0.0260789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0523  hypothetical protein  30.77 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2355  hypothetical protein  25.68 
 
 
300 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.555476  normal  0.544076 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1805  hypothetical protein  24.28 
 
 
262 aa  46.6  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0989937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0218  hypothetical protein  30.85 
 
 
240 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1018  hypothetical protein  30.05 
 
 
263 aa  42.7  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>