More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1024 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1024  pirin domain-containing protein  100 
 
 
232 aa  472  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4505  Pirin-like protein  74.14 
 
 
232 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.222002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4351  Pirin-like  72.84 
 
 
232 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1651  putative Pirin family protein  73.28 
 
 
232 aa  353  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0979  pirin  71.55 
 
 
232 aa  348  3e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.500464  normal  0.866356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4333  pirin domain-containing protein  71.98 
 
 
232 aa  348  5e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0785  Pirin-like  70.69 
 
 
232 aa  347  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0980  Pirin domain protein  71.55 
 
 
232 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4168  hypothetical protein  69.4 
 
 
232 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3215  Pirin domain protein  69.83 
 
 
233 aa  339  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48650  hypothetical protein  68.97 
 
 
232 aa  338  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00951515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1559  pirin domain-containing protein  68.67 
 
 
234 aa  322  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1937  pirin domain-containing protein  68.1 
 
 
233 aa  321  6e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133333  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3304  pirin domain-containing protein  67.24 
 
 
232 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3151  pirin domain-containing protein  67.24 
 
 
232 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.725555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2970  pirin domain-containing protein  67.67 
 
 
232 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496541  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2564  Pirin domain protein  66.81 
 
 
232 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1561  pirin domain-containing protein  65.09 
 
 
238 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2671  Pirin-like  65.09 
 
 
231 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.36625  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1168  Pirin domain protein  66.38 
 
 
233 aa  310  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1638  Pirin-like  65.37 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2811  pirin domain-containing protein  65.09 
 
 
232 aa  302  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0561  Pirin-like protein  63.2 
 
 
232 aa  287  8e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2221  pirin domain-containing protein  60.61 
 
 
236 aa  267  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1316  pirin domain-containing protein  58.37 
 
 
235 aa  259  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0724579  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4093  hypothetical protein  53.91 
 
 
232 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0375  Pirin-like  53.85 
 
 
231 aa  241  9e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4606  pirin domain-containing protein  53.45 
 
 
237 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.593461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1295  hypothetical protein  44.49 
 
 
235 aa  211  9e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1172  pirin domain-containing protein  40.71 
 
 
253 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1963  Pirin domain protein  41.38 
 
 
236 aa  192  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.210241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5153  hypothetical protein  44.2 
 
 
232 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000262926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4868  pirin domain-containing protein  45.98 
 
 
232 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5184  hypothetical protein  44.14 
 
 
232 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.930395  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4908  hypothetical protein  44.2 
 
 
232 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4772  pirin  44.2 
 
 
232 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5283  hypothetical protein  44.2 
 
 
232 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4753  pirin  43.75 
 
 
232 aa  184  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5189  hypothetical protein  43.75 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0143762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5198  hypothetical protein  43.24 
 
 
232 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.312315  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3623  pirin domain-containing protein  43.29 
 
 
232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  43.72 
 
 
235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0060  hypothetical protein  43.75 
 
 
232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.225741  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3095  Pirin domain protein  41.38 
 
 
232 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000217046  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  42.86 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  43.78 
 
 
232 aa  178  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43440  Pirin-like, pirA  41.56 
 
 
229 aa  178  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.277134  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6078  pirin domain-containing protein  41.63 
 
 
241 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371082  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1210  hypothetical protein  41.56 
 
 
241 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114398  normal  0.265926 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  39.66 
 
 
236 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  39.66 
 
 
236 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5842  pirin domain-containing protein  41.2 
 
 
241 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5399  Pirin domain protein  42.06 
 
 
241 aa  175  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102577  normal  0.0781504 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1250  hypothetical protein  43.35 
 
 
232 aa  175  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3903  pirin domain-containing protein  41.13 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3123  Pirin domain protein  40.77 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5765  Pirin-like  40.26 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6612  pirin domain-containing protein  40.26 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.404162 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6130  pirin domain-containing protein  40.26 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1067  Pirin domain protein  41.03 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000189042 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1123  Pirin domain protein  41.56 
 
 
236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7633  Pirin-like protein  40.77 
 
 
241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2268  hypothetical protein  39.91 
 
 
235 aa  172  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  42.92 
 
 
236 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1976  hypothetical protein  41.99 
 
 
241 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.162515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0585  cupin domain-containing protein  41.99 
 
 
241 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4046  pirin domain-containing protein  41.13 
 
 
233 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600908  normal  0.055577 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0678  cupin domain-containing protein  41.99 
 
 
241 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6056  pirin domain-containing protein  41.2 
 
 
241 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127944  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  41.56 
 
 
236 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  42.92 
 
 
232 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0758  pirin domain-containing protein  40.69 
 
 
241 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.966518  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1845  pirin domain-containing protein  40.43 
 
 
234 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4936  Pirin-like  42.92 
 
 
235 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3224  pirin domain-containing protein  42.92 
 
 
235 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.911223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0288  Pirin domain protein  41.99 
 
 
229 aa  168  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1969  hypothetical protein  41.13 
 
 
241 aa  168  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0251  Pirin domain protein  41.56 
 
 
231 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.320122  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0203  Pirin domain protein  41.13 
 
 
232 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3945  Pirin domain protein  40.26 
 
 
231 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1502  Pirin domain protein  39.39 
 
 
233 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.231424  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0902  Pirin, N-terminal  40.26 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1985  pirin domain-containing protein  39.06 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.344267  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3096  Pirin domain protein  41.2 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0932  Pirin domain protein  41.2 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0276  Pirin domain protein  40.69 
 
 
231 aa  165  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47850  Pirin-like protein  40.61 
 
 
242 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1785  Pirin domain protein  39.06 
 
 
233 aa  165  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4422  Pirin-like  39.46 
 
 
238 aa  165  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1955  Pirin-like  38.53 
 
 
240 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2931  pirin domain-containing protein  39.91 
 
 
233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03290  hypothetical protein  40.69 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32251  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3722  pirin family protein  40.69 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3638  pirin family protein  40.69 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.502653  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3886  pirin family protein  40.69 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.688116  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03243  hypothetical protein  40.69 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0688  pirin domain-containing protein  41.33 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0274  pirin domain-containing protein  40.69 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3917  pirin family protein  40.69 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3811  hypothetical protein  40.26 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>